Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
Tspan11Q9D1D1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Tspan11Q9D1D1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Tspan11Q9D1D1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Tspan11Q9D1D1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Tspan11Q9D1D1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Tspan11Q9D1D1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
Tspan11Q9D1D1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Tspan11Q9D1D1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Tspan11Q9D1D1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Tspan11Q9D1D1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Tspan11Q9D1D1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Tspan11Q9D1D1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Tspan11Q9D1D1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Tspan11Q9D1D1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Tspan11Q9D1D1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Tspan11Q9D1D1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Tspan11Q9D1D1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Tspan11Q9D1D1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tspan11Q9D1D1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Tspan11Q9D1D1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Tspan11Q9D1D1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Tspan11Q9D1D1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Tspan11Q9D1D1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Tspan11Q9D1D1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Tspan11Q9D1D1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Tspan11Q9D1D1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Tspan11Q9D1D1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Tspan11Q9D1D1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Tspan11Q9D1D1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Tspan11Q9D1D1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tspan11Q9D1D1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tspan11Q9D1D1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tspan11Q9D1D1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tspan11Q9D1D1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Tspan11Q9D1D1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tspan11Q9D1D1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tspan11Q9D1D1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tspan11Q9D1D1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tspan11Q9D1D1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Tspan11Q9D1D1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tspan11Q9D1D1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tspan11Q9D1D1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tspan11Q9D1D1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tspan11Q9D1D1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tspan11Q9D1D1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tspan11Q9D1D1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Tspan11Q9D1D1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tspan11Q9D1D1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tspan11Q9D1D1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tspan11Q9D1D1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tspan11Q9D1D1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tspan11Q9D1D1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tspan11Q9D1D1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Tspan11Q9D1D1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tspan11Q9D1D1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Tspan11Q9D1D1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tspan11Q9D1D1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tspan11Q9D1D1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tspan11Q9D1D1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tspan11Q9D1D1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Tspan11Q9D1D1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tspan11Q9D1D1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tspan11Q9D1D1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tspan11Q9D1D1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tspan11Q9D1D1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Tspan11Q9D1D1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tspan11Q9D1D1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tspan11Q9D1D1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tspan11Q9D1D1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Tspan11Q9D1D1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tspan11Q9D1D1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tspan11Q9D1D1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tspan11Q9D1D1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tspan11Q9D1D1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tspan11Q9D1D1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Tspan11Q9D1D1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tspan11Q9D1D1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tspan11Q9D1D1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tspan11Q9D1D1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Tspan11Q9D1D1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tspan11Q9D1D1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Tspan11Q9D1D1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tspan11Q9D1D1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tspan11Q9D1D1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tspan11Q9D1D1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tspan11Q9D1D1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tspan11Q9D1D1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tspan11Q9D1D1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tspan11Q9D1D1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tspan11Q9D1D1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tspan11Q9D1D1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tspan11Q9D1D1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Tspan11Q9D1D1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tspan11Q9D1D1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tspan11Q9D1D1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tspan11Q9D1D1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tspan11Q9D1D1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tspan11Q9D1D1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tspan11Q9D1D1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms