Protein–RNA interactions for Protein: P40058

YER085C, Uncharacterized protein YER085C, yeastyeast

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YER085CP40058 KAP120YPL125W 3099 nt0.94□□□□□ -2.26
YER085CP40058 QCR7YDR529C 384 nt0.94□□□□□ -2.26
YER085CP40058 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt0.94□□□□□ -2.26
YER085CP40058 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt0.94□□□□□ -2.26
YER085CP40058 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt0.94□□□□□ -2.26
YER085CP40058 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt0.94□□□□□ -2.26
YER085CP40058 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt0.94□□□□□ -2.26
YER085CP40058 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt0.94□□□□□ -2.26
YER085CP40058 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt0.94□□□□□ -2.26
YER085CP40058 RPS18BYML026C 441 nt0.94□□□□□ -2.26
YER085CP40058 snR14snR14 160 nt0.94□□□□□ -2.26
YER085CP40058 MEI5YPL121C 669 nt0.94□□□□□ -2.26
YER085CP40058 PHR1YOR386W 1698 nt0.94□□□□□ -2.26
YER085CP40058 ROM2YLR371W 4071 nt0.94□□□□□ -2.26
YER085CP40058 YJR029WYJR029W 5268 nt0.93□□□□□ -2.26
YER085CP40058 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.93□□□□□ -2.26
YER085CP40058 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.93□□□□□ -2.26
YER085CP40058 YDR250CYDR250C 276 nt0.93□□□□□ -2.26
YER085CP40058 SCEIQ0160 708 nt0.93□□□□□ -2.26
YER085CP40058 SPO13YHR014W 876 nt0.93□□□□□ -2.26
YER085CP40058 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt0.93□□□□□ -2.26
YER085CP40058 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt0.92□□□□□ -2.26
YER085CP40058 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.92□□□□□ -2.26
YER085CP40058 YBR071WYBR071W 636 nt0.92□□□□□ -2.26
YER085CP40058 YPR099CYPR099C 357 nt0.92□□□□□ -2.26
YER085CP40058 MPT5YGL178W 2580 nt0.92□□□□□ -2.26
YER085CP40058 PIG1YLR273C 1947 nt0.91□□□□□ -2.26
YER085CP40058 CAT8YMR280C 4302 nt0.91□□□□□ -2.26
YER085CP40058 RPL34BYIL052C 366 nt0.91□□□□□ -2.26
YER085CP40058 YLR252WYLR252W 306 nt0.91□□□□□ -2.26
YER085CP40058 DCP1YOL149W 696 nt0.91□□□□□ -2.26
YER085CP40058 IRC23YOR044W 474 nt0.91□□□□□ -2.26
YER085CP40058 SLM6YBR266C 453 nt0.91□□□□□ -2.26
YER085CP40058 CDC39YCR093W 6327 nt0.91□□□□□ -2.26
YER085CP40058 AIM44YPL158C 2277 nt0.91□□□□□ -2.26
YER085CP40058 PAN3YKL025C 2040 nt0.91□□□□□ -2.26
YER085CP40058 AFR1YDR085C 1863 nt0.9□□□□□ -2.26
YER085CP40058 GPM2YDL021W 936 nt0.9□□□□□ -2.27
YER085CP40058 SRP14YDL092W 441 nt0.9□□□□□ -2.27
YER085CP40058 HNT1YDL125C 477 nt0.9□□□□□ -2.27
YER085CP40058 YBR012CYBR012C 420 nt0.9□□□□□ -2.27
YER085CP40058 TOF2YKR010C 2316 nt0.9□□□□□ -2.27
YER085CP40058 YDL187CYDL187C 330 nt0.89□□□□□ -2.27
YER085CP40058 YDR509WYDR509W 348 nt0.89□□□□□ -2.27
YER085CP40058 YEL057CYEL057C 702 nt0.89□□□□□ -2.27
YER085CP40058 AFB1YLR040C 675 nt0.89□□□□□ -2.27
YER085CP40058 YGR130CYGR130C 2451 nt0.89□□□□□ -2.27
YER085CP40058 MKT1YNL085W 2493 nt0.88□□□□□ -2.27
YER085CP40058 YGR045CYGR045C 363 nt0.88□□□□□ -2.27
YER085CP40058 YJR079WYJR079W 330 nt0.88□□□□□ -2.27
YER085CP40058 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.88□□□□□ -2.27
YER085CP40058 IFH1YLR223C 3258 nt0.88□□□□□ -2.27
YER085CP40058 SAS3YBL052C 2496 nt0.88□□□□□ -2.27
YER085CP40058 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.87□□□□□ -2.27
YER085CP40058 YJR087WYJR087W 351 nt0.87□□□□□ -2.27
YER085CP40058 YLR366WYLR366W 306 nt0.87□□□□□ -2.27
YER085CP40058 YOL029CYOL029C 606 nt0.87□□□□□ -2.27
YER085CP40058 YOR248WYOR248W 303 nt0.87□□□□□ -2.27
YER085CP40058 NUT2YPR168W 474 nt0.87□□□□□ -2.27
YER085CP40058 YDR008CYDR008C 351 nt0.86□□□□□ -2.27
YER085CP40058 YDR114CYDR114C 303 nt0.86□□□□□ -2.27
YER085CP40058 CYC7YEL039C 342 nt0.86□□□□□ -2.27
YER085CP40058 SLX9YGR081C 633 nt0.86□□□□□ -2.27
YER085CP40058 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt0.86□□□□□ -2.27
YER085CP40058 YBR032WYBR032W 303 nt0.86□□□□□ -2.27
YER085CP40058 GRX5YPL059W 453 nt0.86□□□□□ -2.27
YER085CP40058 AIM9YER080W 1884 nt0.85□□□□□ -2.27
YER085CP40058 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt0.85□□□□□ -2.27
YER085CP40058 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt0.85□□□□□ -2.27
YER085CP40058 RPL16AYIL133C 600 nt0.85□□□□□ -2.27
YER085CP40058 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.85□□□□□ -2.27
YER085CP40058 PPN1YDR452W 2025 nt0.84□□□□□ -2.27
YER085CP40058 SPO23YBR250W 1572 nt0.84□□□□□ -2.27
YER085CP40058 HIT1YJR055W 495 nt0.84□□□□□ -2.27
YER085CP40058 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt0.84□□□□□ -2.27
YER085CP40058 GMC2YLR445W 567 nt0.84□□□□□ -2.27
YER085CP40058 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.84□□□□□ -2.27
YER085CP40058 RIM20YOR275C 1986 nt0.84□□□□□ -2.28
YER085CP40058 LYS14YDR034C 2373 nt0.84□□□□□ -2.28
YER085CP40058 SCC2YDR180W 4482 nt0.83□□□□□ -2.28
YER085CP40058 SCW11YGL028C 1629 nt0.83□□□□□ -2.28
YER085CP40058 NUP157YER105C 4176 nt0.83□□□□□ -2.28
YER085CP40058 YHL037CYHL037C 402 nt0.83□□□□□ -2.28
YER085CP40058 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.83□□□□□ -2.28
YER085CP40058 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.83□□□□□ -2.28
YER085CP40058 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.83□□□□□ -2.28
YER085CP40058 SET3YKR029C 2256 nt0.83□□□□□ -2.28
YER085CP40058 SMC1YFL008W 3678 nt0.83□□□□□ -2.28
YER085CP40058 SPO11YHL022C 1197 nt0.82□□□□□ -2.28
YER085CP40058 RUF22RUF22 515 nt0.82□□□□□ -2.28
YER085CP40058 snR84snR84 550 nt0.81□□□□□ -2.28
YER085CP40058 SEC28YIL076W 891 nt0.81□□□□□ -2.28
YER085CP40058 SPT7YBR081C 3999 nt0.81□□□□□ -2.28
YER085CP40058 YDL206WYDL206W 2289 nt0.81□□□□□ -2.28
YER085CP40058 NUP192YJL039C 5052 nt0.8□□□□□ -2.28
YER085CP40058 YPR117WYPR117W 7470 nt0.8□□□□□ -2.28
YER085CP40058 PRP21YJL203W 843 nt0.8□□□□□ -2.28
YER085CP40058 SDH2YLL041C 801 nt0.8□□□□□ -2.28
YER085CP40058 GUP1YGL084C 1683 nt0.8□□□□□ -2.28
YER085CP40058 SWI6YLR182W 2412 nt0.8□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.1 ms