Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5T0

Atad1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad1Q9D5T0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atad1Q9D5T0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atad1Q9D5T0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms