Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
9930111J21Rik1Q5SVP0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms