Protein–RNA interactions for Protein: E0CX42

Gm4491, Predicted gene 4491, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4491E0CX42 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Gm4491E0CX42 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.4 ms