Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Knop1Q9Z2Q2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 435.6 ms