Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cnga1P29974 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cnga1P29974 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 255.8 ms