Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

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Length 524 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc1Q80VQ1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc1Q80VQ1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc1Q80VQ1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc1Q80VQ1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc1Q80VQ1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc1Q80VQ1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc1Q80VQ1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc1Q80VQ1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrc1Q80VQ1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Lrrc1Q80VQ1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Lrrc1Q80VQ1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Lrrc1Q80VQ1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Lrrc1Q80VQ1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Lrrc1Q80VQ1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Lrrc1Q80VQ1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrc1Q80VQ1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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