Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Srsf6Q3TWW8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Srsf6Q3TWW8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms