Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2mP61082 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms