Protein–RNA interactions for Protein: P38788

SSZ1, Ribosome-associated complex subunit SSZ1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1P38788 AAD16YFL057C 459 nt2.93□□□□□ -1.94
SSZ1P38788 YLR031WYLR031W 561 nt2.93□□□□□ -1.94
SSZ1P38788 RPL9BYNL067W 576 nt2.93□□□□□ -1.94
SSZ1P38788 RPL25YOL127W 429 nt2.93□□□□□ -1.94
SSZ1P38788 NPR3YHL023C 3441 nt2.93□□□□□ -1.94
SSZ1P38788 YLR278CYLR278C 4026 nt2.93□□□□□ -1.94
SSZ1P38788 IRC10YOL015W 1761 nt2.92□□□□□ -1.94
SSZ1P38788 CYR1YJL005W 6081 nt2.92□□□□□ -1.94
SSZ1P38788 snR79snR79 84 nt2.92□□□□□ -1.94
SSZ1P38788 RAM2YKL019W 951 nt2.92□□□□□ -1.94
SSZ1P38788 RPA190YOR341W 4995 nt2.91□□□□□ -1.94
SSZ1P38788 YCR022CYCR022C 345 nt2.91□□□□□ -1.94
SSZ1P38788 YER097WYER097W 330 nt2.91□□□□□ -1.94
SSZ1P38788 TMA22YJR014W 597 nt2.91□□□□□ -1.94
SSZ1P38788 TIM18YOR297C 579 nt2.91□□□□□ -1.94
SSZ1P38788 TAF2YCR042C 4224 nt2.91□□□□□ -1.94
SSZ1P38788 YTA7YGR270W 4140 nt2.91□□□□□ -1.94
SSZ1P38788 RGR1YLR071C 3249 nt2.91□□□□□ -1.94
SSZ1P38788 SHQ1YIL104C 1524 nt2.9□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 snR76snR76 109 nt2.9□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 SDC1YDR469W 528 nt2.9□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 AYR1YIL124W 894 nt2.9□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 YJL202CYJL202C 348 nt2.9□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 RPS18BYML026C 441 nt2.9□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 ATP3YBR039W 936 nt2.9□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 NAN1YPL126W 2691 nt2.89□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 YDR102CYDR102C 333 nt2.89□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 PCF11YDR228C 1881 nt2.89□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 HMF1YER057C 390 nt2.89□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 RPL40AYIL148W 387 nt2.89□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 AIM26YKL037W 357 nt2.89□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 IRC23YOR044W 474 nt2.89□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 LCL1YPL056C 306 nt2.89□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 ROX1YPR065W 1107 nt2.89□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 YBR197CYBR197C 654 nt2.89□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 VPS41YDR080W 2979 nt2.89□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 RIF1YBR275C 5751 nt2.88□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 ASG1YIL130W 2895 nt2.88□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 NAB3YPL190C 2409 nt2.88□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 NMD2YHR077C 3270 nt2.88□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 AKR1YDR264C 2295 nt2.88□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 YFR056CYFR056C 369 nt2.88□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.88□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.88□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 DNL4YOR005C 2835 nt2.88□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 TLC1TLC1 1301 nt2.88□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.87□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.87□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.87□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.87□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.87□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.87□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.87□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 RGM1YMR182C 636 nt2.87□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 RPL20AYMR242C 519 nt2.87□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 PGA1YNL158W 597 nt2.87□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 CDC20YGL116W 1833 nt2.86□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 snR65snR65 100 nt2.86□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 YDL011CYDL011C 324 nt2.86□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 MZM1YDR493W 372 nt2.86□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 YKL083WYKL083W 615 nt2.86□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 UTP30YKR060W 825 nt2.86□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 YPR146CYPR146C 330 nt2.86□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 snR36snR36 182 nt2.86□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 REV1YOR346W 2958 nt2.86□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 CDC24YAL041W 2565 nt2.85□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 YFL032WYFL032W 321 nt2.85□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 RPL26AYLR344W 384 nt2.85□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 YNL010WYNL010W 726 nt2.85□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 ORC1YML065W 2745 nt2.85□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 ESC1YMR219W 4977 nt2.85□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.84□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 YHL005CYHL005C 393 nt2.84□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 FCF2YLR051C 654 nt2.84□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 YBL073WYBL073W 312 nt2.84□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 ROG1YGL144C 2058 nt2.84□□□□□ -1.95
SSZ1P38788 KSP1YHR082C 3090 nt2.84□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 YDR193WYDR193W 399 nt2.83□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 ISF1YMR081C 1017 nt2.83□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 YMR324CYMR324C 243 nt2.83□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 YPL182CYPL182C 384 nt2.83□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 VPS64YDR200C 1815 nt2.83□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 CAF120YNL278W 3183 nt2.83□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 DUG2YBR281C 2637 nt2.83□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 NFT1YKR103W 3657 nt2.82□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 STE6YKL209C 3873 nt2.82□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 WIP1YDR374W-A 270 nt2.82□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 YER121WYER121W 345 nt2.82□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.82□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 YOR282WYOR282W 321 nt2.82□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 YPR089WYPR089W 2667 nt2.81□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.81□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 DAD4YDR320C-A 219 nt2.81□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 YDR366CYDR366C 399 nt2.81□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 LSO2YGR169C-A 279 nt2.81□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 RPL39YJL189W 156 nt2.81□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 YGR067CYGR067C 2415 nt2.81□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 GIN4YDR507C 3429 nt2.8□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 KAR3YPR141C 2190 nt2.8□□□□□ -1.96
SSZ1P38788 RPL6AYML073C 531 nt2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 76.1 ms