Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrit3W8DXL4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lrit3W8DXL4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrit3W8DXL4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lrit3W8DXL4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrit3W8DXL4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lrit3W8DXL4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrit3W8DXL4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrit3W8DXL4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrit3W8DXL4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrit3W8DXL4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lrit3W8DXL4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrit3W8DXL4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lrit3W8DXL4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrit3W8DXL4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lrit3W8DXL4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrit3W8DXL4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrit3W8DXL4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lrit3W8DXL4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrit3W8DXL4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrit3W8DXL4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrit3W8DXL4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrit3W8DXL4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrit3W8DXL4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrit3W8DXL4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrit3W8DXL4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrit3W8DXL4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrit3W8DXL4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrit3W8DXL4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrit3W8DXL4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrit3W8DXL4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrit3W8DXL4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrit3W8DXL4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrit3W8DXL4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrit3W8DXL4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrit3W8DXL4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrit3W8DXL4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrit3W8DXL4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrit3W8DXL4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrit3W8DXL4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrit3W8DXL4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrit3W8DXL4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrit3W8DXL4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrit3W8DXL4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrit3W8DXL4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrit3W8DXL4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrit3W8DXL4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrit3W8DXL4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrit3W8DXL4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrit3W8DXL4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrit3W8DXL4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrit3W8DXL4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrit3W8DXL4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrit3W8DXL4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrit3W8DXL4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrit3W8DXL4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrit3W8DXL4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrit3W8DXL4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrit3W8DXL4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrit3W8DXL4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrit3W8DXL4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrit3W8DXL4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrit3W8DXL4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrit3W8DXL4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrit3W8DXL4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrit3W8DXL4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrit3W8DXL4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrit3W8DXL4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrit3W8DXL4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrit3W8DXL4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrit3W8DXL4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrit3W8DXL4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrit3W8DXL4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrit3W8DXL4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrit3W8DXL4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrit3W8DXL4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrit3W8DXL4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrit3W8DXL4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrit3W8DXL4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrit3W8DXL4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrit3W8DXL4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrit3W8DXL4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrit3W8DXL4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrit3W8DXL4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrit3W8DXL4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrit3W8DXL4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrit3W8DXL4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrit3W8DXL4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrit3W8DXL4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrit3W8DXL4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrit3W8DXL4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrit3W8DXL4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrit3W8DXL4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrit3W8DXL4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrit3W8DXL4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrit3W8DXL4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrit3W8DXL4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrit3W8DXL4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrit3W8DXL4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrit3W8DXL4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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