Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Top3bQ9Z321 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Top3bQ9Z321 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Top3bQ9Z321 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Top3bQ9Z321 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top3bQ9Z321 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top3bQ9Z321 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Top3bQ9Z321 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top3bQ9Z321 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top3bQ9Z321 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top3bQ9Z321 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top3bQ9Z321 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top3bQ9Z321 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Top3bQ9Z321 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Top3bQ9Z321 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Top3bQ9Z321 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Top3bQ9Z321 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Top3bQ9Z321 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Top3bQ9Z321 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Top3bQ9Z321 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Top3bQ9Z321 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top3bQ9Z321 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top3bQ9Z321 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top3bQ9Z321 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top3bQ9Z321 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top3bQ9Z321 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top3bQ9Z321 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top3bQ9Z321 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top3bQ9Z321 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top3bQ9Z321 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top3bQ9Z321 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top3bQ9Z321 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top3bQ9Z321 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top3bQ9Z321 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top3bQ9Z321 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top3bQ9Z321 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top3bQ9Z321 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top3bQ9Z321 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top3bQ9Z321 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top3bQ9Z321 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top3bQ9Z321 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top3bQ9Z321 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top3bQ9Z321 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top3bQ9Z321 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top3bQ9Z321 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top3bQ9Z321 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top3bQ9Z321 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Top3bQ9Z321 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top3bQ9Z321 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Top3bQ9Z321 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top3bQ9Z321 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top3bQ9Z321 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top3bQ9Z321 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Top3bQ9Z321 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top3bQ9Z321 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top3bQ9Z321 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Top3bQ9Z321 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top3bQ9Z321 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Top3bQ9Z321 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top3bQ9Z321 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Top3bQ9Z321 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top3bQ9Z321 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top3bQ9Z321 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Top3bQ9Z321 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Top3bQ9Z321 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Top3bQ9Z321 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top3bQ9Z321 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Top3bQ9Z321 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Top3bQ9Z321 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Top3bQ9Z321 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Top3bQ9Z321 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Top3bQ9Z321 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top3bQ9Z321 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Top3bQ9Z321 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Top3bQ9Z321 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Top3bQ9Z321 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Top3bQ9Z321 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top3bQ9Z321 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top3bQ9Z321 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top3bQ9Z321 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Top3bQ9Z321 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top3bQ9Z321 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Top3bQ9Z321 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Top3bQ9Z321 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top3bQ9Z321 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Top3bQ9Z321 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top3bQ9Z321 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Top3bQ9Z321 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Top3bQ9Z321 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Top3bQ9Z321 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Top3bQ9Z321 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Top3bQ9Z321 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top3bQ9Z321 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top3bQ9Z321 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top3bQ9Z321 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top3bQ9Z321 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Top3bQ9Z321 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top3bQ9Z321 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top3bQ9Z321 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Top3bQ9Z321 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms