Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Robo3Q9Z2I4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Robo3Q9Z2I4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Robo3Q9Z2I4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Robo3Q9Z2I4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Robo3Q9Z2I4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Robo3Q9Z2I4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Robo3Q9Z2I4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Robo3Q9Z2I4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Robo3Q9Z2I4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Robo3Q9Z2I4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Robo3Q9Z2I4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Robo3Q9Z2I4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Robo3Q9Z2I4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Robo3Q9Z2I4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Robo3Q9Z2I4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Robo3Q9Z2I4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Robo3Q9Z2I4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Robo3Q9Z2I4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Robo3Q9Z2I4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Robo3Q9Z2I4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Robo3Q9Z2I4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Robo3Q9Z2I4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Robo3Q9Z2I4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Robo3Q9Z2I4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Robo3Q9Z2I4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Robo3Q9Z2I4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Robo3Q9Z2I4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Robo3Q9Z2I4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Robo3Q9Z2I4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Robo3Q9Z2I4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Robo3Q9Z2I4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Robo3Q9Z2I4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Robo3Q9Z2I4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Robo3Q9Z2I4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Robo3Q9Z2I4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Robo3Q9Z2I4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Robo3Q9Z2I4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Robo3Q9Z2I4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Robo3Q9Z2I4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Robo3Q9Z2I4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Robo3Q9Z2I4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Robo3Q9Z2I4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Robo3Q9Z2I4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Robo3Q9Z2I4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Robo3Q9Z2I4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Robo3Q9Z2I4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Robo3Q9Z2I4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Robo3Q9Z2I4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Robo3Q9Z2I4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Robo3Q9Z2I4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Robo3Q9Z2I4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Robo3Q9Z2I4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Robo3Q9Z2I4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Robo3Q9Z2I4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Robo3Q9Z2I4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Robo3Q9Z2I4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Robo3Q9Z2I4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Robo3Q9Z2I4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Robo3Q9Z2I4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Robo3Q9Z2I4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Robo3Q9Z2I4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Robo3Q9Z2I4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Robo3Q9Z2I4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Robo3Q9Z2I4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Robo3Q9Z2I4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Robo3Q9Z2I4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Robo3Q9Z2I4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Robo3Q9Z2I4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Robo3Q9Z2I4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Robo3Q9Z2I4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Robo3Q9Z2I4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Robo3Q9Z2I4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Robo3Q9Z2I4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Robo3Q9Z2I4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Robo3Q9Z2I4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Robo3Q9Z2I4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Robo3Q9Z2I4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Robo3Q9Z2I4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Robo3Q9Z2I4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Robo3Q9Z2I4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Robo3Q9Z2I4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Robo3Q9Z2I4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Robo3Q9Z2I4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Robo3Q9Z2I4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Robo3Q9Z2I4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Robo3Q9Z2I4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Robo3Q9Z2I4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Robo3Q9Z2I4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Robo3Q9Z2I4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Robo3Q9Z2I4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Robo3Q9Z2I4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Robo3Q9Z2I4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Robo3Q9Z2I4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Robo3Q9Z2I4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Robo3Q9Z2I4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Robo3Q9Z2I4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Robo3Q9Z2I4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Robo3Q9Z2I4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Robo3Q9Z2I4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms