Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tulp1Q9Z273 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tulp1Q9Z273 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tulp1Q9Z273 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tulp1Q9Z273 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tulp1Q9Z273 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tulp1Q9Z273 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Tulp1Q9Z273 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tulp1Q9Z273 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tulp1Q9Z273 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tulp1Q9Z273 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tulp1Q9Z273 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tulp1Q9Z273 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tulp1Q9Z273 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tulp1Q9Z273 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tulp1Q9Z273 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tulp1Q9Z273 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tulp1Q9Z273 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tulp1Q9Z273 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tulp1Q9Z273 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tulp1Q9Z273 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tulp1Q9Z273 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tulp1Q9Z273 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tulp1Q9Z273 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tulp1Q9Z273 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tulp1Q9Z273 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tulp1Q9Z273 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tulp1Q9Z273 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tulp1Q9Z273 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tulp1Q9Z273 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tulp1Q9Z273 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tulp1Q9Z273 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Tulp1Q9Z273 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tulp1Q9Z273 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Tulp1Q9Z273 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tulp1Q9Z273 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tulp1Q9Z273 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tulp1Q9Z273 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tulp1Q9Z273 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tulp1Q9Z273 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tulp1Q9Z273 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tulp1Q9Z273 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tulp1Q9Z273 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tulp1Q9Z273 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tulp1Q9Z273 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tulp1Q9Z273 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tulp1Q9Z273 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tulp1Q9Z273 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tulp1Q9Z273 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tulp1Q9Z273 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tulp1Q9Z273 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tulp1Q9Z273 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tulp1Q9Z273 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tulp1Q9Z273 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tulp1Q9Z273 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tulp1Q9Z273 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tulp1Q9Z273 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tulp1Q9Z273 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Tulp1Q9Z273 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tulp1Q9Z273 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tulp1Q9Z273 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tulp1Q9Z273 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tulp1Q9Z273 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tulp1Q9Z273 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tulp1Q9Z273 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tulp1Q9Z273 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tulp1Q9Z273 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tulp1Q9Z273 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tulp1Q9Z273 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tulp1Q9Z273 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tulp1Q9Z273 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tulp1Q9Z273 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tulp1Q9Z273 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tulp1Q9Z273 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tulp1Q9Z273 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Tulp1Q9Z273 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tulp1Q9Z273 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tulp1Q9Z273 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tulp1Q9Z273 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tulp1Q9Z273 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tulp1Q9Z273 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tulp1Q9Z273 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tulp1Q9Z273 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tulp1Q9Z273 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tulp1Q9Z273 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tulp1Q9Z273 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tulp1Q9Z273 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tulp1Q9Z273 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tulp1Q9Z273 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tulp1Q9Z273 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tulp1Q9Z273 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tulp1Q9Z273 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tulp1Q9Z273 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tulp1Q9Z273 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tulp1Q9Z273 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tulp1Q9Z273 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tulp1Q9Z273 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tulp1Q9Z273 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tulp1Q9Z273 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tulp1Q9Z273 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms