Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1S5

Sept3, Neuronal-specific septin-3, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept3Q9Z1S5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sept3Q9Z1S5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sept3Q9Z1S5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sept3Q9Z1S5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sept3Q9Z1S5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sept3Q9Z1S5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sept3Q9Z1S5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sept3Q9Z1S5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Sept3Q9Z1S5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sept3Q9Z1S5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sept3Q9Z1S5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sept3Q9Z1S5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sept3Q9Z1S5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sept3Q9Z1S5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sept3Q9Z1S5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sept3Q9Z1S5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sept3Q9Z1S5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sept3Q9Z1S5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sept3Q9Z1S5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sept3Q9Z1S5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sept3Q9Z1S5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sept3Q9Z1S5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sept3Q9Z1S5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sept3Q9Z1S5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sept3Q9Z1S5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sept3Q9Z1S5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sept3Q9Z1S5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Sept3Q9Z1S5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sept3Q9Z1S5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sept3Q9Z1S5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sept3Q9Z1S5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sept3Q9Z1S5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sept3Q9Z1S5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sept3Q9Z1S5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sept3Q9Z1S5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sept3Q9Z1S5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sept3Q9Z1S5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sept3Q9Z1S5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sept3Q9Z1S5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sept3Q9Z1S5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sept3Q9Z1S5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Sept3Q9Z1S5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Sept3Q9Z1S5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sept3Q9Z1S5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sept3Q9Z1S5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sept3Q9Z1S5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Sept3Q9Z1S5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sept3Q9Z1S5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sept3Q9Z1S5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sept3Q9Z1S5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sept3Q9Z1S5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sept3Q9Z1S5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sept3Q9Z1S5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sept3Q9Z1S5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sept3Q9Z1S5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sept3Q9Z1S5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sept3Q9Z1S5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sept3Q9Z1S5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sept3Q9Z1S5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sept3Q9Z1S5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sept3Q9Z1S5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sept3Q9Z1S5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sept3Q9Z1S5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sept3Q9Z1S5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sept3Q9Z1S5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sept3Q9Z1S5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sept3Q9Z1S5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Sept3Q9Z1S5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Sept3Q9Z1S5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Sept3Q9Z1S5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sept3Q9Z1S5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sept3Q9Z1S5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sept3Q9Z1S5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sept3Q9Z1S5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sept3Q9Z1S5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sept3Q9Z1S5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sept3Q9Z1S5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sept3Q9Z1S5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sept3Q9Z1S5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sept3Q9Z1S5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sept3Q9Z1S5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sept3Q9Z1S5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sept3Q9Z1S5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sept3Q9Z1S5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sept3Q9Z1S5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sept3Q9Z1S5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sept3Q9Z1S5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Sept3Q9Z1S5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sept3Q9Z1S5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sept3Q9Z1S5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sept3Q9Z1S5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sept3Q9Z1S5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sept3Q9Z1S5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sept3Q9Z1S5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sept3Q9Z1S5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sept3Q9Z1S5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sept3Q9Z1S5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sept3Q9Z1S5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sept3Q9Z1S5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sept3Q9Z1S5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms