Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
VarsQ9Z1Q9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VarsQ9Z1Q9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VarsQ9Z1Q9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
VarsQ9Z1Q9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
VarsQ9Z1Q9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VarsQ9Z1Q9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VarsQ9Z1Q9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VarsQ9Z1Q9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VarsQ9Z1Q9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VarsQ9Z1Q9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VarsQ9Z1Q9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VarsQ9Z1Q9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VarsQ9Z1Q9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VarsQ9Z1Q9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VarsQ9Z1Q9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VarsQ9Z1Q9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VarsQ9Z1Q9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VarsQ9Z1Q9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VarsQ9Z1Q9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VarsQ9Z1Q9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VarsQ9Z1Q9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VarsQ9Z1Q9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VarsQ9Z1Q9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VarsQ9Z1Q9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VarsQ9Z1Q9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VarsQ9Z1Q9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VarsQ9Z1Q9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VarsQ9Z1Q9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VarsQ9Z1Q9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VarsQ9Z1Q9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VarsQ9Z1Q9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VarsQ9Z1Q9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VarsQ9Z1Q9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VarsQ9Z1Q9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VarsQ9Z1Q9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VarsQ9Z1Q9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VarsQ9Z1Q9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VarsQ9Z1Q9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VarsQ9Z1Q9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VarsQ9Z1Q9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VarsQ9Z1Q9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VarsQ9Z1Q9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VarsQ9Z1Q9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VarsQ9Z1Q9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VarsQ9Z1Q9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VarsQ9Z1Q9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VarsQ9Z1Q9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VarsQ9Z1Q9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VarsQ9Z1Q9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VarsQ9Z1Q9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VarsQ9Z1Q9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VarsQ9Z1Q9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VarsQ9Z1Q9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VarsQ9Z1Q9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VarsQ9Z1Q9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
VarsQ9Z1Q9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VarsQ9Z1Q9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VarsQ9Z1Q9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VarsQ9Z1Q9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VarsQ9Z1Q9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VarsQ9Z1Q9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VarsQ9Z1Q9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VarsQ9Z1Q9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VarsQ9Z1Q9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VarsQ9Z1Q9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VarsQ9Z1Q9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VarsQ9Z1Q9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VarsQ9Z1Q9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VarsQ9Z1Q9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VarsQ9Z1Q9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VarsQ9Z1Q9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VarsQ9Z1Q9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VarsQ9Z1Q9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VarsQ9Z1Q9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VarsQ9Z1Q9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VarsQ9Z1Q9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VarsQ9Z1Q9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VarsQ9Z1Q9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VarsQ9Z1Q9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VarsQ9Z1Q9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VarsQ9Z1Q9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VarsQ9Z1Q9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VarsQ9Z1Q9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VarsQ9Z1Q9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VarsQ9Z1Q9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VarsQ9Z1Q9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VarsQ9Z1Q9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VarsQ9Z1Q9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VarsQ9Z1Q9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
VarsQ9Z1Q9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VarsQ9Z1Q9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VarsQ9Z1Q9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VarsQ9Z1Q9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VarsQ9Z1Q9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VarsQ9Z1Q9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VarsQ9Z1Q9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VarsQ9Z1Q9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VarsQ9Z1Q9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VarsQ9Z1Q9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms