Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pcm1Q9R0L6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcm1Q9R0L6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pcm1Q9R0L6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pcm1Q9R0L6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pcm1Q9R0L6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcm1Q9R0L6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcm1Q9R0L6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcm1Q9R0L6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcm1Q9R0L6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pcm1Q9R0L6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcm1Q9R0L6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pcm1Q9R0L6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcm1Q9R0L6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pcm1Q9R0L6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcm1Q9R0L6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pcm1Q9R0L6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcm1Q9R0L6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pcm1Q9R0L6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcm1Q9R0L6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcm1Q9R0L6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcm1Q9R0L6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pcm1Q9R0L6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pcm1Q9R0L6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pcm1Q9R0L6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcm1Q9R0L6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcm1Q9R0L6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcm1Q9R0L6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pcm1Q9R0L6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcm1Q9R0L6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pcm1Q9R0L6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcm1Q9R0L6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pcm1Q9R0L6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcm1Q9R0L6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcm1Q9R0L6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pcm1Q9R0L6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcm1Q9R0L6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcm1Q9R0L6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcm1Q9R0L6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcm1Q9R0L6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcm1Q9R0L6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pcm1Q9R0L6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pcm1Q9R0L6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pcm1Q9R0L6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pcm1Q9R0L6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcm1Q9R0L6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcm1Q9R0L6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcm1Q9R0L6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pcm1Q9R0L6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcm1Q9R0L6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcm1Q9R0L6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pcm1Q9R0L6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcm1Q9R0L6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcm1Q9R0L6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcm1Q9R0L6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pcm1Q9R0L6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Pcm1Q9R0L6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pcm1Q9R0L6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pcm1Q9R0L6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcm1Q9R0L6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcm1Q9R0L6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pcm1Q9R0L6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcm1Q9R0L6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pcm1Q9R0L6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcm1Q9R0L6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcm1Q9R0L6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pcm1Q9R0L6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pcm1Q9R0L6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcm1Q9R0L6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcm1Q9R0L6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pcm1Q9R0L6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcm1Q9R0L6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcm1Q9R0L6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pcm1Q9R0L6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcm1Q9R0L6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pcm1Q9R0L6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcm1Q9R0L6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pcm1Q9R0L6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcm1Q9R0L6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcm1Q9R0L6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcm1Q9R0L6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pcm1Q9R0L6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcm1Q9R0L6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pcm1Q9R0L6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcm1Q9R0L6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcm1Q9R0L6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcm1Q9R0L6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcm1Q9R0L6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcm1Q9R0L6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcm1Q9R0L6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcm1Q9R0L6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcm1Q9R0L6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcm1Q9R0L6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcm1Q9R0L6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcm1Q9R0L6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcm1Q9R0L6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcm1Q9R0L6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcm1Q9R0L6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcm1Q9R0L6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcm1Q9R0L6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms