Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CtsfQ9R013 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CtsfQ9R013 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CtsfQ9R013 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CtsfQ9R013 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CtsfQ9R013 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CtsfQ9R013 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CtsfQ9R013 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CtsfQ9R013 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CtsfQ9R013 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CtsfQ9R013 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CtsfQ9R013 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CtsfQ9R013 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CtsfQ9R013 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CtsfQ9R013 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CtsfQ9R013 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CtsfQ9R013 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CtsfQ9R013 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CtsfQ9R013 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CtsfQ9R013 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CtsfQ9R013 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CtsfQ9R013 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CtsfQ9R013 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CtsfQ9R013 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CtsfQ9R013 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CtsfQ9R013 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CtsfQ9R013 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CtsfQ9R013 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CtsfQ9R013 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CtsfQ9R013 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CtsfQ9R013 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CtsfQ9R013 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CtsfQ9R013 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CtsfQ9R013 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CtsfQ9R013 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CtsfQ9R013 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CtsfQ9R013 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CtsfQ9R013 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CtsfQ9R013 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CtsfQ9R013 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CtsfQ9R013 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CtsfQ9R013 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CtsfQ9R013 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CtsfQ9R013 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CtsfQ9R013 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CtsfQ9R013 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CtsfQ9R013 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CtsfQ9R013 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CtsfQ9R013 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CtsfQ9R013 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CtsfQ9R013 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CtsfQ9R013 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CtsfQ9R013 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CtsfQ9R013 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CtsfQ9R013 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CtsfQ9R013 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CtsfQ9R013 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CtsfQ9R013 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CtsfQ9R013 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CtsfQ9R013 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CtsfQ9R013 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CtsfQ9R013 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CtsfQ9R013 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CtsfQ9R013 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CtsfQ9R013 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CtsfQ9R013 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CtsfQ9R013 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CtsfQ9R013 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CtsfQ9R013 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CtsfQ9R013 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CtsfQ9R013 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CtsfQ9R013 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CtsfQ9R013 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CtsfQ9R013 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CtsfQ9R013 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CtsfQ9R013 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CtsfQ9R013 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CtsfQ9R013 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CtsfQ9R013 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CtsfQ9R013 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CtsfQ9R013 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CtsfQ9R013 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CtsfQ9R013 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CtsfQ9R013 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CtsfQ9R013 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CtsfQ9R013 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CtsfQ9R013 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CtsfQ9R013 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CtsfQ9R013 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CtsfQ9R013 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CtsfQ9R013 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CtsfQ9R013 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CtsfQ9R013 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CtsfQ9R013 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CtsfQ9R013 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CtsfQ9R013 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CtsfQ9R013 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CtsfQ9R013 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CtsfQ9R013 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CtsfQ9R013 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms