Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT1

Rnf32, RING finger protein 32, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf32Q9JIT1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf32Q9JIT1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf32Q9JIT1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf32Q9JIT1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf32Q9JIT1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf32Q9JIT1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf32Q9JIT1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf32Q9JIT1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf32Q9JIT1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf32Q9JIT1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf32Q9JIT1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf32Q9JIT1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf32Q9JIT1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf32Q9JIT1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf32Q9JIT1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf32Q9JIT1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf32Q9JIT1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf32Q9JIT1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf32Q9JIT1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf32Q9JIT1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf32Q9JIT1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf32Q9JIT1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf32Q9JIT1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf32Q9JIT1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf32Q9JIT1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf32Q9JIT1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf32Q9JIT1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf32Q9JIT1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf32Q9JIT1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf32Q9JIT1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf32Q9JIT1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf32Q9JIT1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf32Q9JIT1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf32Q9JIT1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf32Q9JIT1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf32Q9JIT1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf32Q9JIT1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf32Q9JIT1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf32Q9JIT1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf32Q9JIT1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf32Q9JIT1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf32Q9JIT1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf32Q9JIT1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf32Q9JIT1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf32Q9JIT1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf32Q9JIT1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf32Q9JIT1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf32Q9JIT1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf32Q9JIT1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf32Q9JIT1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rnf32Q9JIT1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf32Q9JIT1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf32Q9JIT1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf32Q9JIT1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf32Q9JIT1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf32Q9JIT1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf32Q9JIT1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf32Q9JIT1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf32Q9JIT1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf32Q9JIT1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf32Q9JIT1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf32Q9JIT1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf32Q9JIT1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf32Q9JIT1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf32Q9JIT1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf32Q9JIT1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf32Q9JIT1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf32Q9JIT1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf32Q9JIT1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf32Q9JIT1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf32Q9JIT1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf32Q9JIT1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf32Q9JIT1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf32Q9JIT1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf32Q9JIT1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf32Q9JIT1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf32Q9JIT1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf32Q9JIT1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf32Q9JIT1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf32Q9JIT1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf32Q9JIT1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf32Q9JIT1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf32Q9JIT1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf32Q9JIT1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf32Q9JIT1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf32Q9JIT1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf32Q9JIT1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf32Q9JIT1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf32Q9JIT1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf32Q9JIT1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf32Q9JIT1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf32Q9JIT1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf32Q9JIT1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf32Q9JIT1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf32Q9JIT1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf32Q9JIT1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf32Q9JIT1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf32Q9JIT1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf32Q9JIT1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf32Q9JIT1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms