Protein–RNA interactions for Protein: Q9JID9

Sh2b2, SH2B adapter protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2b2Q9JID9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sh2b2Q9JID9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Sh2b2Q9JID9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sh2b2Q9JID9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Sh2b2Q9JID9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Sh2b2Q9JID9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Sh2b2Q9JID9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sh2b2Q9JID9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sh2b2Q9JID9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sh2b2Q9JID9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Sh2b2Q9JID9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Sh2b2Q9JID9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sh2b2Q9JID9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sh2b2Q9JID9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Sh2b2Q9JID9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Sh2b2Q9JID9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sh2b2Q9JID9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Sh2b2Q9JID9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Sh2b2Q9JID9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Sh2b2Q9JID9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Sh2b2Q9JID9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sh2b2Q9JID9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sh2b2Q9JID9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Sh2b2Q9JID9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Sh2b2Q9JID9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sh2b2Q9JID9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Sh2b2Q9JID9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sh2b2Q9JID9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sh2b2Q9JID9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sh2b2Q9JID9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sh2b2Q9JID9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sh2b2Q9JID9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Sh2b2Q9JID9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sh2b2Q9JID9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sh2b2Q9JID9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Sh2b2Q9JID9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sh2b2Q9JID9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sh2b2Q9JID9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sh2b2Q9JID9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sh2b2Q9JID9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sh2b2Q9JID9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Sh2b2Q9JID9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sh2b2Q9JID9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sh2b2Q9JID9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Sh2b2Q9JID9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sh2b2Q9JID9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sh2b2Q9JID9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sh2b2Q9JID9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sh2b2Q9JID9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sh2b2Q9JID9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sh2b2Q9JID9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sh2b2Q9JID9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sh2b2Q9JID9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sh2b2Q9JID9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Sh2b2Q9JID9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Sh2b2Q9JID9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sh2b2Q9JID9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sh2b2Q9JID9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sh2b2Q9JID9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sh2b2Q9JID9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sh2b2Q9JID9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sh2b2Q9JID9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sh2b2Q9JID9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sh2b2Q9JID9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sh2b2Q9JID9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sh2b2Q9JID9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sh2b2Q9JID9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sh2b2Q9JID9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sh2b2Q9JID9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sh2b2Q9JID9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sh2b2Q9JID9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Sh2b2Q9JID9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.56■■■□□ 2
Sh2b2Q9JID9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sh2b2Q9JID9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sh2b2Q9JID9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Sh2b2Q9JID9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sh2b2Q9JID9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sh2b2Q9JID9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sh2b2Q9JID9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Sh2b2Q9JID9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Sh2b2Q9JID9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Sh2b2Q9JID9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sh2b2Q9JID9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sh2b2Q9JID9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sh2b2Q9JID9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sh2b2Q9JID9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sh2b2Q9JID9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sh2b2Q9JID9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Sh2b2Q9JID9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sh2b2Q9JID9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sh2b2Q9JID9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sh2b2Q9JID9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Sh2b2Q9JID9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sh2b2Q9JID9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sh2b2Q9JID9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sh2b2Q9JID9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sh2b2Q9JID9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sh2b2Q9JID9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sh2b2Q9JID9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sh2b2Q9JID9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms