Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIC3

Dclre1a, DNA cross-link repair 1A protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1aQ9JIC3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Dclre1aQ9JIC3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dclre1aQ9JIC3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dclre1aQ9JIC3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dclre1aQ9JIC3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dclre1aQ9JIC3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dclre1aQ9JIC3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Dclre1aQ9JIC3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Dclre1aQ9JIC3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dclre1aQ9JIC3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Dclre1aQ9JIC3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dclre1aQ9JIC3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dclre1aQ9JIC3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dclre1aQ9JIC3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dclre1aQ9JIC3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dclre1aQ9JIC3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dclre1aQ9JIC3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dclre1aQ9JIC3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dclre1aQ9JIC3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Dclre1aQ9JIC3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Dclre1aQ9JIC3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dclre1aQ9JIC3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dclre1aQ9JIC3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dclre1aQ9JIC3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dclre1aQ9JIC3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dclre1aQ9JIC3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Dclre1aQ9JIC3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dclre1aQ9JIC3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dclre1aQ9JIC3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dclre1aQ9JIC3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Dclre1aQ9JIC3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dclre1aQ9JIC3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dclre1aQ9JIC3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dclre1aQ9JIC3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Dclre1aQ9JIC3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Dclre1aQ9JIC3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dclre1aQ9JIC3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dclre1aQ9JIC3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dclre1aQ9JIC3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dclre1aQ9JIC3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dclre1aQ9JIC3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Dclre1aQ9JIC3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dclre1aQ9JIC3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dclre1aQ9JIC3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Dclre1aQ9JIC3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dclre1aQ9JIC3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dclre1aQ9JIC3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dclre1aQ9JIC3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dclre1aQ9JIC3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Dclre1aQ9JIC3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dclre1aQ9JIC3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dclre1aQ9JIC3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dclre1aQ9JIC3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Dclre1aQ9JIC3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Dclre1aQ9JIC3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dclre1aQ9JIC3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dclre1aQ9JIC3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dclre1aQ9JIC3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dclre1aQ9JIC3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Dclre1aQ9JIC3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dclre1aQ9JIC3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dclre1aQ9JIC3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Dclre1aQ9JIC3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Dclre1aQ9JIC3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dclre1aQ9JIC3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dclre1aQ9JIC3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dclre1aQ9JIC3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Dclre1aQ9JIC3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dclre1aQ9JIC3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dclre1aQ9JIC3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dclre1aQ9JIC3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Dclre1aQ9JIC3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dclre1aQ9JIC3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dclre1aQ9JIC3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Dclre1aQ9JIC3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dclre1aQ9JIC3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dclre1aQ9JIC3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dclre1aQ9JIC3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dclre1aQ9JIC3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Dclre1aQ9JIC3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Dclre1aQ9JIC3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dclre1aQ9JIC3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Dclre1aQ9JIC3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Dclre1aQ9JIC3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dclre1aQ9JIC3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Dclre1aQ9JIC3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Dclre1aQ9JIC3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dclre1aQ9JIC3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Dclre1aQ9JIC3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dclre1aQ9JIC3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Dclre1aQ9JIC3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dclre1aQ9JIC3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dclre1aQ9JIC3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dclre1aQ9JIC3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Dclre1aQ9JIC3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dclre1aQ9JIC3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dclre1aQ9JIC3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dclre1aQ9JIC3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dclre1aQ9JIC3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dclre1aQ9JIC3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.9 ms