Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA75

Mfsd2a, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd2aQ9DA75 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mfsd2aQ9DA75 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mfsd2aQ9DA75 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mfsd2aQ9DA75 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mfsd2aQ9DA75 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mfsd2aQ9DA75 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mfsd2aQ9DA75 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mfsd2aQ9DA75 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mfsd2aQ9DA75 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mfsd2aQ9DA75 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mfsd2aQ9DA75 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mfsd2aQ9DA75 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mfsd2aQ9DA75 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mfsd2aQ9DA75 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mfsd2aQ9DA75 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Mfsd2aQ9DA75 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mfsd2aQ9DA75 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mfsd2aQ9DA75 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mfsd2aQ9DA75 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mfsd2aQ9DA75 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mfsd2aQ9DA75 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mfsd2aQ9DA75 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mfsd2aQ9DA75 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mfsd2aQ9DA75 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mfsd2aQ9DA75 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mfsd2aQ9DA75 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mfsd2aQ9DA75 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mfsd2aQ9DA75 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mfsd2aQ9DA75 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mfsd2aQ9DA75 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mfsd2aQ9DA75 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mfsd2aQ9DA75 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Mfsd2aQ9DA75 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mfsd2aQ9DA75 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mfsd2aQ9DA75 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mfsd2aQ9DA75 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mfsd2aQ9DA75 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mfsd2aQ9DA75 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mfsd2aQ9DA75 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mfsd2aQ9DA75 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mfsd2aQ9DA75 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mfsd2aQ9DA75 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mfsd2aQ9DA75 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mfsd2aQ9DA75 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mfsd2aQ9DA75 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mfsd2aQ9DA75 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mfsd2aQ9DA75 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mfsd2aQ9DA75 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mfsd2aQ9DA75 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mfsd2aQ9DA75 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mfsd2aQ9DA75 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mfsd2aQ9DA75 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mfsd2aQ9DA75 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mfsd2aQ9DA75 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mfsd2aQ9DA75 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mfsd2aQ9DA75 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mfsd2aQ9DA75 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mfsd2aQ9DA75 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mfsd2aQ9DA75 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mfsd2aQ9DA75 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mfsd2aQ9DA75 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mfsd2aQ9DA75 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mfsd2aQ9DA75 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mfsd2aQ9DA75 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mfsd2aQ9DA75 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mfsd2aQ9DA75 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mfsd2aQ9DA75 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mfsd2aQ9DA75 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mfsd2aQ9DA75 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mfsd2aQ9DA75 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mfsd2aQ9DA75 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mfsd2aQ9DA75 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mfsd2aQ9DA75 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mfsd2aQ9DA75 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mfsd2aQ9DA75 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mfsd2aQ9DA75 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mfsd2aQ9DA75 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mfsd2aQ9DA75 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mfsd2aQ9DA75 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Mfsd2aQ9DA75 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mfsd2aQ9DA75 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mfsd2aQ9DA75 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mfsd2aQ9DA75 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Mfsd2aQ9DA75 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mfsd2aQ9DA75 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mfsd2aQ9DA75 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mfsd2aQ9DA75 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mfsd2aQ9DA75 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mfsd2aQ9DA75 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mfsd2aQ9DA75 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mfsd2aQ9DA75 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mfsd2aQ9DA75 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mfsd2aQ9DA75 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mfsd2aQ9DA75 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mfsd2aQ9DA75 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mfsd2aQ9DA75 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mfsd2aQ9DA75 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mfsd2aQ9DA75 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mfsd2aQ9DA75 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mfsd2aQ9DA75 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms