Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA04

Tmem89, Transmembrane protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem89Q9DA04 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem89Q9DA04 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem89Q9DA04 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem89Q9DA04 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem89Q9DA04 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem89Q9DA04 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem89Q9DA04 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem89Q9DA04 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem89Q9DA04 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem89Q9DA04 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem89Q9DA04 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem89Q9DA04 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem89Q9DA04 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem89Q9DA04 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem89Q9DA04 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem89Q9DA04 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem89Q9DA04 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem89Q9DA04 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem89Q9DA04 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem89Q9DA04 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem89Q9DA04 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem89Q9DA04 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem89Q9DA04 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem89Q9DA04 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem89Q9DA04 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem89Q9DA04 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem89Q9DA04 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem89Q9DA04 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem89Q9DA04 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem89Q9DA04 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem89Q9DA04 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem89Q9DA04 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem89Q9DA04 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem89Q9DA04 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem89Q9DA04 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem89Q9DA04 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem89Q9DA04 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem89Q9DA04 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem89Q9DA04 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem89Q9DA04 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem89Q9DA04 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem89Q9DA04 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem89Q9DA04 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem89Q9DA04 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem89Q9DA04 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem89Q9DA04 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem89Q9DA04 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem89Q9DA04 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem89Q9DA04 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem89Q9DA04 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem89Q9DA04 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem89Q9DA04 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem89Q9DA04 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem89Q9DA04 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem89Q9DA04 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem89Q9DA04 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem89Q9DA04 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem89Q9DA04 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem89Q9DA04 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem89Q9DA04 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem89Q9DA04 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem89Q9DA04 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem89Q9DA04 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem89Q9DA04 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem89Q9DA04 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem89Q9DA04 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem89Q9DA04 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem89Q9DA04 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem89Q9DA04 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem89Q9DA04 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem89Q9DA04 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem89Q9DA04 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem89Q9DA04 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem89Q9DA04 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem89Q9DA04 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem89Q9DA04 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem89Q9DA04 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem89Q9DA04 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem89Q9DA04 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem89Q9DA04 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem89Q9DA04 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem89Q9DA04 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem89Q9DA04 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem89Q9DA04 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem89Q9DA04 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem89Q9DA04 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem89Q9DA04 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem89Q9DA04 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem89Q9DA04 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem89Q9DA04 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem89Q9DA04 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem89Q9DA04 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem89Q9DA04 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem89Q9DA04 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem89Q9DA04 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem89Q9DA04 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem89Q9DA04 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem89Q9DA04 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem89Q9DA04 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem89Q9DA04 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms