Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ91

Srfbp1, Serum response factor-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srfbp1Q9CZ91 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Srfbp1Q9CZ91 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Srfbp1Q9CZ91 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srfbp1Q9CZ91 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srfbp1Q9CZ91 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srfbp1Q9CZ91 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Srfbp1Q9CZ91 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srfbp1Q9CZ91 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srfbp1Q9CZ91 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Srfbp1Q9CZ91 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srfbp1Q9CZ91 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srfbp1Q9CZ91 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srfbp1Q9CZ91 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srfbp1Q9CZ91 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srfbp1Q9CZ91 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srfbp1Q9CZ91 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srfbp1Q9CZ91 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srfbp1Q9CZ91 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Srfbp1Q9CZ91 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srfbp1Q9CZ91 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srfbp1Q9CZ91 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srfbp1Q9CZ91 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srfbp1Q9CZ91 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srfbp1Q9CZ91 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srfbp1Q9CZ91 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Srfbp1Q9CZ91 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srfbp1Q9CZ91 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srfbp1Q9CZ91 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srfbp1Q9CZ91 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srfbp1Q9CZ91 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Srfbp1Q9CZ91 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srfbp1Q9CZ91 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Srfbp1Q9CZ91 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srfbp1Q9CZ91 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srfbp1Q9CZ91 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srfbp1Q9CZ91 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srfbp1Q9CZ91 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srfbp1Q9CZ91 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srfbp1Q9CZ91 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srfbp1Q9CZ91 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srfbp1Q9CZ91 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srfbp1Q9CZ91 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srfbp1Q9CZ91 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srfbp1Q9CZ91 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Srfbp1Q9CZ91 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srfbp1Q9CZ91 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srfbp1Q9CZ91 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Srfbp1Q9CZ91 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srfbp1Q9CZ91 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srfbp1Q9CZ91 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srfbp1Q9CZ91 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srfbp1Q9CZ91 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srfbp1Q9CZ91 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srfbp1Q9CZ91 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srfbp1Q9CZ91 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srfbp1Q9CZ91 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srfbp1Q9CZ91 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srfbp1Q9CZ91 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srfbp1Q9CZ91 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srfbp1Q9CZ91 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srfbp1Q9CZ91 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srfbp1Q9CZ91 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srfbp1Q9CZ91 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srfbp1Q9CZ91 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srfbp1Q9CZ91 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srfbp1Q9CZ91 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srfbp1Q9CZ91 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srfbp1Q9CZ91 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Srfbp1Q9CZ91 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srfbp1Q9CZ91 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srfbp1Q9CZ91 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srfbp1Q9CZ91 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srfbp1Q9CZ91 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srfbp1Q9CZ91 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Srfbp1Q9CZ91 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srfbp1Q9CZ91 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srfbp1Q9CZ91 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srfbp1Q9CZ91 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srfbp1Q9CZ91 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srfbp1Q9CZ91 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Srfbp1Q9CZ91 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srfbp1Q9CZ91 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srfbp1Q9CZ91 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srfbp1Q9CZ91 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srfbp1Q9CZ91 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srfbp1Q9CZ91 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srfbp1Q9CZ91 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srfbp1Q9CZ91 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srfbp1Q9CZ91 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srfbp1Q9CZ91 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srfbp1Q9CZ91 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srfbp1Q9CZ91 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srfbp1Q9CZ91 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srfbp1Q9CZ91 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srfbp1Q9CZ91 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srfbp1Q9CZ91 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srfbp1Q9CZ91 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srfbp1Q9CZ91 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srfbp1Q9CZ91 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Srfbp1Q9CZ91 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms