Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHI5

Vit, Vitrin, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VitQ8VHI5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VitQ8VHI5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VitQ8VHI5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VitQ8VHI5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VitQ8VHI5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VitQ8VHI5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VitQ8VHI5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VitQ8VHI5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VitQ8VHI5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VitQ8VHI5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VitQ8VHI5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VitQ8VHI5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VitQ8VHI5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VitQ8VHI5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VitQ8VHI5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VitQ8VHI5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VitQ8VHI5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VitQ8VHI5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VitQ8VHI5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VitQ8VHI5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VitQ8VHI5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VitQ8VHI5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VitQ8VHI5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VitQ8VHI5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VitQ8VHI5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VitQ8VHI5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VitQ8VHI5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
VitQ8VHI5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VitQ8VHI5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
VitQ8VHI5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VitQ8VHI5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VitQ8VHI5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
VitQ8VHI5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VitQ8VHI5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VitQ8VHI5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VitQ8VHI5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VitQ8VHI5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VitQ8VHI5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VitQ8VHI5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VitQ8VHI5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VitQ8VHI5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VitQ8VHI5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VitQ8VHI5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VitQ8VHI5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VitQ8VHI5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VitQ8VHI5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VitQ8VHI5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VitQ8VHI5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VitQ8VHI5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VitQ8VHI5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VitQ8VHI5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VitQ8VHI5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VitQ8VHI5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VitQ8VHI5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VitQ8VHI5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VitQ8VHI5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VitQ8VHI5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VitQ8VHI5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VitQ8VHI5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VitQ8VHI5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VitQ8VHI5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VitQ8VHI5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VitQ8VHI5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VitQ8VHI5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VitQ8VHI5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VitQ8VHI5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VitQ8VHI5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VitQ8VHI5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VitQ8VHI5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VitQ8VHI5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VitQ8VHI5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VitQ8VHI5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VitQ8VHI5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VitQ8VHI5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VitQ8VHI5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VitQ8VHI5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VitQ8VHI5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VitQ8VHI5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VitQ8VHI5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VitQ8VHI5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VitQ8VHI5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VitQ8VHI5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VitQ8VHI5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VitQ8VHI5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VitQ8VHI5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VitQ8VHI5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VitQ8VHI5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VitQ8VHI5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VitQ8VHI5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VitQ8VHI5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VitQ8VHI5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VitQ8VHI5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VitQ8VHI5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VitQ8VHI5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VitQ8VHI5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VitQ8VHI5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VitQ8VHI5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VitQ8VHI5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VitQ8VHI5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VitQ8VHI5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms