Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCF5

Tspan10, Tetraspanin-10, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan10Q8VCF5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan10Q8VCF5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan10Q8VCF5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan10Q8VCF5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan10Q8VCF5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan10Q8VCF5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan10Q8VCF5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tspan10Q8VCF5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tspan10Q8VCF5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan10Q8VCF5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan10Q8VCF5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tspan10Q8VCF5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan10Q8VCF5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan10Q8VCF5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tspan10Q8VCF5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan10Q8VCF5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan10Q8VCF5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan10Q8VCF5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tspan10Q8VCF5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Tspan10Q8VCF5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tspan10Q8VCF5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan10Q8VCF5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan10Q8VCF5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tspan10Q8VCF5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan10Q8VCF5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan10Q8VCF5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tspan10Q8VCF5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan10Q8VCF5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tspan10Q8VCF5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan10Q8VCF5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan10Q8VCF5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tspan10Q8VCF5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan10Q8VCF5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tspan10Q8VCF5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tspan10Q8VCF5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tspan10Q8VCF5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tspan10Q8VCF5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan10Q8VCF5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan10Q8VCF5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan10Q8VCF5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tspan10Q8VCF5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan10Q8VCF5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tspan10Q8VCF5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan10Q8VCF5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan10Q8VCF5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan10Q8VCF5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tspan10Q8VCF5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan10Q8VCF5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan10Q8VCF5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan10Q8VCF5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tspan10Q8VCF5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tspan10Q8VCF5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tspan10Q8VCF5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tspan10Q8VCF5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan10Q8VCF5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan10Q8VCF5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan10Q8VCF5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Tspan10Q8VCF5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan10Q8VCF5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan10Q8VCF5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan10Q8VCF5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan10Q8VCF5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan10Q8VCF5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tspan10Q8VCF5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan10Q8VCF5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan10Q8VCF5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tspan10Q8VCF5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan10Q8VCF5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan10Q8VCF5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tspan10Q8VCF5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tspan10Q8VCF5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan10Q8VCF5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan10Q8VCF5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan10Q8VCF5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan10Q8VCF5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tspan10Q8VCF5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tspan10Q8VCF5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan10Q8VCF5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan10Q8VCF5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan10Q8VCF5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tspan10Q8VCF5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan10Q8VCF5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan10Q8VCF5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tspan10Q8VCF5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tspan10Q8VCF5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan10Q8VCF5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tspan10Q8VCF5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan10Q8VCF5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tspan10Q8VCF5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan10Q8VCF5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tspan10Q8VCF5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan10Q8VCF5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan10Q8VCF5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan10Q8VCF5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tspan10Q8VCF5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan10Q8VCF5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan10Q8VCF5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tspan10Q8VCF5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan10Q8VCF5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tspan10Q8VCF5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms