Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCF5

Tspan10, Tetraspanin-10, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan10Q8VCF5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Tspan10Q8VCF5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Tspan10Q8VCF5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Tspan10Q8VCF5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Tspan10Q8VCF5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tspan10Q8VCF5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Tspan10Q8VCF5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tspan10Q8VCF5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Tspan10Q8VCF5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tspan10Q8VCF5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Tspan10Q8VCF5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tspan10Q8VCF5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tspan10Q8VCF5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Tspan10Q8VCF5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tspan10Q8VCF5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Tspan10Q8VCF5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Tspan10Q8VCF5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Tspan10Q8VCF5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Tspan10Q8VCF5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tspan10Q8VCF5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tspan10Q8VCF5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tspan10Q8VCF5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tspan10Q8VCF5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Tspan10Q8VCF5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tspan10Q8VCF5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Tspan10Q8VCF5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tspan10Q8VCF5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tspan10Q8VCF5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tspan10Q8VCF5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tspan10Q8VCF5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Tspan10Q8VCF5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tspan10Q8VCF5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tspan10Q8VCF5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tspan10Q8VCF5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tspan10Q8VCF5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tspan10Q8VCF5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tspan10Q8VCF5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Tspan10Q8VCF5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tspan10Q8VCF5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tspan10Q8VCF5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tspan10Q8VCF5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tspan10Q8VCF5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tspan10Q8VCF5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tspan10Q8VCF5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tspan10Q8VCF5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tspan10Q8VCF5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tspan10Q8VCF5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tspan10Q8VCF5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tspan10Q8VCF5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tspan10Q8VCF5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tspan10Q8VCF5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tspan10Q8VCF5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tspan10Q8VCF5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tspan10Q8VCF5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tspan10Q8VCF5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tspan10Q8VCF5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tspan10Q8VCF5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tspan10Q8VCF5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tspan10Q8VCF5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tspan10Q8VCF5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tspan10Q8VCF5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tspan10Q8VCF5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tspan10Q8VCF5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tspan10Q8VCF5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tspan10Q8VCF5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Tspan10Q8VCF5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tspan10Q8VCF5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tspan10Q8VCF5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tspan10Q8VCF5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Tspan10Q8VCF5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tspan10Q8VCF5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tspan10Q8VCF5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Tspan10Q8VCF5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tspan10Q8VCF5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tspan10Q8VCF5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tspan10Q8VCF5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tspan10Q8VCF5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tspan10Q8VCF5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Tspan10Q8VCF5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tspan10Q8VCF5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tspan10Q8VCF5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tspan10Q8VCF5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tspan10Q8VCF5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tspan10Q8VCF5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Tspan10Q8VCF5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tspan10Q8VCF5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Tspan10Q8VCF5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tspan10Q8VCF5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tspan10Q8VCF5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tspan10Q8VCF5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tspan10Q8VCF5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tspan10Q8VCF5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tspan10Q8VCF5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Tspan10Q8VCF5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tspan10Q8VCF5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tspan10Q8VCF5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tspan10Q8VCF5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tspan10Q8VCF5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tspan10Q8VCF5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tspan10Q8VCF5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
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