Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc15Q8C9M2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc15Q8C9M2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc15Q8C9M2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ccdc15Q8C9M2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc15Q8C9M2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc15Q8C9M2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc15Q8C9M2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc15Q8C9M2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc15Q8C9M2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc15Q8C9M2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc15Q8C9M2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc15Q8C9M2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc15Q8C9M2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc15Q8C9M2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc15Q8C9M2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc15Q8C9M2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc15Q8C9M2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc15Q8C9M2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc15Q8C9M2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc15Q8C9M2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc15Q8C9M2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc15Q8C9M2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc15Q8C9M2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc15Q8C9M2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc15Q8C9M2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc15Q8C9M2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc15Q8C9M2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc15Q8C9M2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc15Q8C9M2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc15Q8C9M2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc15Q8C9M2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc15Q8C9M2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc15Q8C9M2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc15Q8C9M2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc15Q8C9M2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc15Q8C9M2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc15Q8C9M2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc15Q8C9M2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc15Q8C9M2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc15Q8C9M2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc15Q8C9M2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc15Q8C9M2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc15Q8C9M2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc15Q8C9M2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc15Q8C9M2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ccdc15Q8C9M2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc15Q8C9M2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc15Q8C9M2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc15Q8C9M2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc15Q8C9M2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc15Q8C9M2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc15Q8C9M2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc15Q8C9M2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc15Q8C9M2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc15Q8C9M2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc15Q8C9M2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc15Q8C9M2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc15Q8C9M2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc15Q8C9M2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc15Q8C9M2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc15Q8C9M2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc15Q8C9M2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc15Q8C9M2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc15Q8C9M2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc15Q8C9M2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc15Q8C9M2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc15Q8C9M2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc15Q8C9M2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc15Q8C9M2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc15Q8C9M2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc15Q8C9M2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc15Q8C9M2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc15Q8C9M2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc15Q8C9M2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc15Q8C9M2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc15Q8C9M2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc15Q8C9M2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc15Q8C9M2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc15Q8C9M2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc15Q8C9M2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc15Q8C9M2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc15Q8C9M2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc15Q8C9M2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc15Q8C9M2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc15Q8C9M2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc15Q8C9M2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc15Q8C9M2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc15Q8C9M2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc15Q8C9M2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc15Q8C9M2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc15Q8C9M2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc15Q8C9M2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc15Q8C9M2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc15Q8C9M2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc15Q8C9M2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc15Q8C9M2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc15Q8C9M2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc15Q8C9M2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc15Q8C9M2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms