Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aph1bQ8C7N7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aph1bQ8C7N7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aph1bQ8C7N7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Aph1bQ8C7N7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aph1bQ8C7N7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Aph1bQ8C7N7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aph1bQ8C7N7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aph1bQ8C7N7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aph1bQ8C7N7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aph1bQ8C7N7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aph1bQ8C7N7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aph1bQ8C7N7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aph1bQ8C7N7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aph1bQ8C7N7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aph1bQ8C7N7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aph1bQ8C7N7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aph1bQ8C7N7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aph1bQ8C7N7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aph1bQ8C7N7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Aph1bQ8C7N7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Aph1bQ8C7N7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Aph1bQ8C7N7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aph1bQ8C7N7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aph1bQ8C7N7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aph1bQ8C7N7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aph1bQ8C7N7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aph1bQ8C7N7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aph1bQ8C7N7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aph1bQ8C7N7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aph1bQ8C7N7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aph1bQ8C7N7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aph1bQ8C7N7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Aph1bQ8C7N7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aph1bQ8C7N7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aph1bQ8C7N7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aph1bQ8C7N7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aph1bQ8C7N7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aph1bQ8C7N7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aph1bQ8C7N7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aph1bQ8C7N7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aph1bQ8C7N7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aph1bQ8C7N7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aph1bQ8C7N7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aph1bQ8C7N7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aph1bQ8C7N7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aph1bQ8C7N7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aph1bQ8C7N7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aph1bQ8C7N7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Aph1bQ8C7N7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aph1bQ8C7N7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aph1bQ8C7N7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aph1bQ8C7N7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aph1bQ8C7N7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aph1bQ8C7N7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aph1bQ8C7N7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aph1bQ8C7N7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aph1bQ8C7N7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aph1bQ8C7N7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aph1bQ8C7N7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aph1bQ8C7N7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aph1bQ8C7N7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aph1bQ8C7N7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aph1bQ8C7N7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aph1bQ8C7N7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aph1bQ8C7N7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aph1bQ8C7N7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aph1bQ8C7N7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aph1bQ8C7N7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aph1bQ8C7N7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aph1bQ8C7N7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aph1bQ8C7N7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Aph1bQ8C7N7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Aph1bQ8C7N7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Aph1bQ8C7N7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Aph1bQ8C7N7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aph1bQ8C7N7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aph1bQ8C7N7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aph1bQ8C7N7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aph1bQ8C7N7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Aph1bQ8C7N7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Aph1bQ8C7N7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aph1bQ8C7N7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aph1bQ8C7N7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Aph1bQ8C7N7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aph1bQ8C7N7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aph1bQ8C7N7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aph1bQ8C7N7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aph1bQ8C7N7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aph1bQ8C7N7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aph1bQ8C7N7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aph1bQ8C7N7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aph1bQ8C7N7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Aph1bQ8C7N7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aph1bQ8C7N7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aph1bQ8C7N7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aph1bQ8C7N7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aph1bQ8C7N7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Aph1bQ8C7N7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Aph1bQ8C7N7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms