Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kdm4aQ8BW72 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm4aQ8BW72 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm4aQ8BW72 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm4aQ8BW72 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm4aQ8BW72 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm4aQ8BW72 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm4aQ8BW72 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm4aQ8BW72 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm4aQ8BW72 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm4aQ8BW72 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm4aQ8BW72 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm4aQ8BW72 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm4aQ8BW72 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm4aQ8BW72 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm4aQ8BW72 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm4aQ8BW72 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Kdm4aQ8BW72 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Kdm4aQ8BW72 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm4aQ8BW72 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm4aQ8BW72 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm4aQ8BW72 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm4aQ8BW72 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm4aQ8BW72 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm4aQ8BW72 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm4aQ8BW72 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm4aQ8BW72 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm4aQ8BW72 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm4aQ8BW72 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm4aQ8BW72 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm4aQ8BW72 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm4aQ8BW72 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm4aQ8BW72 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm4aQ8BW72 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Kdm4aQ8BW72 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm4aQ8BW72 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Kdm4aQ8BW72 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm4aQ8BW72 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm4aQ8BW72 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm4aQ8BW72 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Kdm4aQ8BW72 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm4aQ8BW72 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Kdm4aQ8BW72 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm4aQ8BW72 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Kdm4aQ8BW72 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Kdm4aQ8BW72 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm4aQ8BW72 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm4aQ8BW72 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Kdm4aQ8BW72 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm4aQ8BW72 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm4aQ8BW72 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm4aQ8BW72 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm4aQ8BW72 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm4aQ8BW72 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm4aQ8BW72 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Kdm4aQ8BW72 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm4aQ8BW72 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm4aQ8BW72 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Kdm4aQ8BW72 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm4aQ8BW72 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Kdm4aQ8BW72 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Kdm4aQ8BW72 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Kdm4aQ8BW72 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm4aQ8BW72 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Kdm4aQ8BW72 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm4aQ8BW72 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Kdm4aQ8BW72 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Kdm4aQ8BW72 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm4aQ8BW72 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Kdm4aQ8BW72 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm4aQ8BW72 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm4aQ8BW72 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm4aQ8BW72 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Kdm4aQ8BW72 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kdm4aQ8BW72 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kdm4aQ8BW72 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Kdm4aQ8BW72 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm4aQ8BW72 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm4aQ8BW72 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Kdm4aQ8BW72 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Kdm4aQ8BW72 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm4aQ8BW72 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm4aQ8BW72 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm4aQ8BW72 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Kdm4aQ8BW72 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm4aQ8BW72 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm4aQ8BW72 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Kdm4aQ8BW72 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Kdm4aQ8BW72 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm4aQ8BW72 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm4aQ8BW72 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm4aQ8BW72 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm4aQ8BW72 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Kdm4aQ8BW72 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm4aQ8BW72 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm4aQ8BW72 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Kdm4aQ8BW72 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm4aQ8BW72 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm4aQ8BW72 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm4aQ8BW72 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms