Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tmem87bQ8BKU8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tmem87bQ8BKU8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tmem87bQ8BKU8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tmem87bQ8BKU8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Tmem87bQ8BKU8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tmem87bQ8BKU8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tmem87bQ8BKU8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tmem87bQ8BKU8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tmem87bQ8BKU8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tmem87bQ8BKU8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tmem87bQ8BKU8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tmem87bQ8BKU8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tmem87bQ8BKU8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tmem87bQ8BKU8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tmem87bQ8BKU8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tmem87bQ8BKU8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Tmem87bQ8BKU8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tmem87bQ8BKU8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tmem87bQ8BKU8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Tmem87bQ8BKU8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tmem87bQ8BKU8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tmem87bQ8BKU8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Tmem87bQ8BKU8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Tmem87bQ8BKU8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tmem87bQ8BKU8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tmem87bQ8BKU8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tmem87bQ8BKU8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Tmem87bQ8BKU8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Tmem87bQ8BKU8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Tmem87bQ8BKU8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tmem87bQ8BKU8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Tmem87bQ8BKU8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tmem87bQ8BKU8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tmem87bQ8BKU8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tmem87bQ8BKU8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tmem87bQ8BKU8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tmem87bQ8BKU8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tmem87bQ8BKU8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tmem87bQ8BKU8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tmem87bQ8BKU8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tmem87bQ8BKU8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tmem87bQ8BKU8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tmem87bQ8BKU8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tmem87bQ8BKU8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tmem87bQ8BKU8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tmem87bQ8BKU8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Tmem87bQ8BKU8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tmem87bQ8BKU8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tmem87bQ8BKU8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tmem87bQ8BKU8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tmem87bQ8BKU8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tmem87bQ8BKU8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tmem87bQ8BKU8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tmem87bQ8BKU8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Tmem87bQ8BKU8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Tmem87bQ8BKU8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tmem87bQ8BKU8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tmem87bQ8BKU8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tmem87bQ8BKU8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tmem87bQ8BKU8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tmem87bQ8BKU8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Tmem87bQ8BKU8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tmem87bQ8BKU8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Tmem87bQ8BKU8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tmem87bQ8BKU8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tmem87bQ8BKU8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Tmem87bQ8BKU8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tmem87bQ8BKU8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tmem87bQ8BKU8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tmem87bQ8BKU8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tmem87bQ8BKU8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tmem87bQ8BKU8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tmem87bQ8BKU8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tmem87bQ8BKU8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tmem87bQ8BKU8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tmem87bQ8BKU8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tmem87bQ8BKU8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tmem87bQ8BKU8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tmem87bQ8BKU8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tmem87bQ8BKU8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tmem87bQ8BKU8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tmem87bQ8BKU8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Tmem87bQ8BKU8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tmem87bQ8BKU8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tmem87bQ8BKU8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tmem87bQ8BKU8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tmem87bQ8BKU8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tmem87bQ8BKU8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tmem87bQ8BKU8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tmem87bQ8BKU8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tmem87bQ8BKU8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tmem87bQ8BKU8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tmem87bQ8BKU8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tmem87bQ8BKU8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tmem87bQ8BKU8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tmem87bQ8BKU8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Tmem87bQ8BKU8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tmem87bQ8BKU8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tmem87bQ8BKU8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms