Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJZ4

Mrps35, 28S ribosomal protein S35, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps35Q8BJZ4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mrps35Q8BJZ4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrps35Q8BJZ4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mrps35Q8BJZ4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrps35Q8BJZ4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mrps35Q8BJZ4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrps35Q8BJZ4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mrps35Q8BJZ4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mrps35Q8BJZ4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Mrps35Q8BJZ4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrps35Q8BJZ4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mrps35Q8BJZ4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrps35Q8BJZ4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mrps35Q8BJZ4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrps35Q8BJZ4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrps35Q8BJZ4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrps35Q8BJZ4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrps35Q8BJZ4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Mrps35Q8BJZ4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrps35Q8BJZ4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrps35Q8BJZ4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mrps35Q8BJZ4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrps35Q8BJZ4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrps35Q8BJZ4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrps35Q8BJZ4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mrps35Q8BJZ4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mrps35Q8BJZ4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrps35Q8BJZ4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrps35Q8BJZ4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrps35Q8BJZ4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrps35Q8BJZ4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mrps35Q8BJZ4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrps35Q8BJZ4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrps35Q8BJZ4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrps35Q8BJZ4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrps35Q8BJZ4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mrps35Q8BJZ4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrps35Q8BJZ4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrps35Q8BJZ4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrps35Q8BJZ4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrps35Q8BJZ4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrps35Q8BJZ4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mrps35Q8BJZ4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mrps35Q8BJZ4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrps35Q8BJZ4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mrps35Q8BJZ4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mrps35Q8BJZ4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mrps35Q8BJZ4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Mrps35Q8BJZ4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mrps35Q8BJZ4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrps35Q8BJZ4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrps35Q8BJZ4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mrps35Q8BJZ4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrps35Q8BJZ4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrps35Q8BJZ4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrps35Q8BJZ4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrps35Q8BJZ4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mrps35Q8BJZ4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrps35Q8BJZ4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mrps35Q8BJZ4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrps35Q8BJZ4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrps35Q8BJZ4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrps35Q8BJZ4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mrps35Q8BJZ4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrps35Q8BJZ4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrps35Q8BJZ4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrps35Q8BJZ4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrps35Q8BJZ4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mrps35Q8BJZ4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mrps35Q8BJZ4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrps35Q8BJZ4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrps35Q8BJZ4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrps35Q8BJZ4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mrps35Q8BJZ4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mrps35Q8BJZ4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrps35Q8BJZ4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mrps35Q8BJZ4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrps35Q8BJZ4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrps35Q8BJZ4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrps35Q8BJZ4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mrps35Q8BJZ4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrps35Q8BJZ4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrps35Q8BJZ4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrps35Q8BJZ4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrps35Q8BJZ4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mrps35Q8BJZ4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrps35Q8BJZ4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrps35Q8BJZ4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mrps35Q8BJZ4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrps35Q8BJZ4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrps35Q8BJZ4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mrps35Q8BJZ4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mrps35Q8BJZ4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mrps35Q8BJZ4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mrps35Q8BJZ4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mrps35Q8BJZ4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mrps35Q8BJZ4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrps35Q8BJZ4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrps35Q8BJZ4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mrps35Q8BJZ4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms