Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SnupnQ80W37 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SnupnQ80W37 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SnupnQ80W37 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SnupnQ80W37 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SnupnQ80W37 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SnupnQ80W37 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SnupnQ80W37 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SnupnQ80W37 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnupnQ80W37 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SnupnQ80W37 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnupnQ80W37 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SnupnQ80W37 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SnupnQ80W37 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SnupnQ80W37 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SnupnQ80W37 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SnupnQ80W37 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SnupnQ80W37 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SnupnQ80W37 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnupnQ80W37 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnupnQ80W37 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnupnQ80W37 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SnupnQ80W37 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnupnQ80W37 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SnupnQ80W37 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnupnQ80W37 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnupnQ80W37 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SnupnQ80W37 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SnupnQ80W37 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SnupnQ80W37 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SnupnQ80W37 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SnupnQ80W37 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SnupnQ80W37 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnupnQ80W37 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnupnQ80W37 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnupnQ80W37 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SnupnQ80W37 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnupnQ80W37 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SnupnQ80W37 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SnupnQ80W37 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SnupnQ80W37 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnupnQ80W37 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnupnQ80W37 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnupnQ80W37 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SnupnQ80W37 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SnupnQ80W37 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnupnQ80W37 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnupnQ80W37 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnupnQ80W37 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnupnQ80W37 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SnupnQ80W37 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnupnQ80W37 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnupnQ80W37 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SnupnQ80W37 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SnupnQ80W37 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnupnQ80W37 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnupnQ80W37 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnupnQ80W37 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnupnQ80W37 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnupnQ80W37 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SnupnQ80W37 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SnupnQ80W37 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SnupnQ80W37 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SnupnQ80W37 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SnupnQ80W37 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnupnQ80W37 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnupnQ80W37 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnupnQ80W37 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SnupnQ80W37 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SnupnQ80W37 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SnupnQ80W37 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SnupnQ80W37 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SnupnQ80W37 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SnupnQ80W37 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SnupnQ80W37 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SnupnQ80W37 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SnupnQ80W37 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SnupnQ80W37 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnupnQ80W37 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnupnQ80W37 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnupnQ80W37 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnupnQ80W37 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SnupnQ80W37 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SnupnQ80W37 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SnupnQ80W37 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SnupnQ80W37 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SnupnQ80W37 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SnupnQ80W37 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnupnQ80W37 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SnupnQ80W37 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SnupnQ80W37 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SnupnQ80W37 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SnupnQ80W37 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SnupnQ80W37 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SnupnQ80W37 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SnupnQ80W37 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SnupnQ80W37 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SnupnQ80W37 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnupnQ80W37 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SnupnQ80W37 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms