Protein–RNA interactions for Protein: Q80SY5

Prpf38b, Pre-mRNA-splicing factor 38B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38bQ80SY5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prpf38bQ80SY5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prpf38bQ80SY5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Prpf38bQ80SY5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prpf38bQ80SY5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Prpf38bQ80SY5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prpf38bQ80SY5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Prpf38bQ80SY5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prpf38bQ80SY5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Prpf38bQ80SY5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prpf38bQ80SY5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Prpf38bQ80SY5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Prpf38bQ80SY5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Prpf38bQ80SY5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Prpf38bQ80SY5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf38bQ80SY5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf38bQ80SY5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Prpf38bQ80SY5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf38bQ80SY5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf38bQ80SY5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf38bQ80SY5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf38bQ80SY5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf38bQ80SY5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Prpf38bQ80SY5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Prpf38bQ80SY5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpf38bQ80SY5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpf38bQ80SY5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Prpf38bQ80SY5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Prpf38bQ80SY5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Prpf38bQ80SY5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prpf38bQ80SY5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Prpf38bQ80SY5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf38bQ80SY5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf38bQ80SY5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf38bQ80SY5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Prpf38bQ80SY5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prpf38bQ80SY5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Prpf38bQ80SY5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpf38bQ80SY5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpf38bQ80SY5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Prpf38bQ80SY5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpf38bQ80SY5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpf38bQ80SY5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpf38bQ80SY5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Prpf38bQ80SY5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Prpf38bQ80SY5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf38bQ80SY5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Prpf38bQ80SY5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf38bQ80SY5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Prpf38bQ80SY5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf38bQ80SY5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Prpf38bQ80SY5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf38bQ80SY5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Prpf38bQ80SY5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf38bQ80SY5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf38bQ80SY5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf38bQ80SY5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf38bQ80SY5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Prpf38bQ80SY5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Prpf38bQ80SY5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf38bQ80SY5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf38bQ80SY5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Prpf38bQ80SY5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prpf38bQ80SY5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Prpf38bQ80SY5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prpf38bQ80SY5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prpf38bQ80SY5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Prpf38bQ80SY5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf38bQ80SY5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf38bQ80SY5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf38bQ80SY5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Prpf38bQ80SY5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpf38bQ80SY5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpf38bQ80SY5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Prpf38bQ80SY5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Prpf38bQ80SY5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Prpf38bQ80SY5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf38bQ80SY5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf38bQ80SY5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf38bQ80SY5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf38bQ80SY5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf38bQ80SY5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf38bQ80SY5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Prpf38bQ80SY5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf38bQ80SY5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf38bQ80SY5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf38bQ80SY5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf38bQ80SY5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prpf38bQ80SY5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf38bQ80SY5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf38bQ80SY5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prpf38bQ80SY5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prpf38bQ80SY5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prpf38bQ80SY5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prpf38bQ80SY5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf38bQ80SY5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf38bQ80SY5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf38bQ80SY5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf38bQ80SY5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prpf38bQ80SY5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms