Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPQ6

Pitpnm2, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pitpnm2Q6ZPQ6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pitpnm2Q6ZPQ6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pitpnm2Q6ZPQ6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pitpnm2Q6ZPQ6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Pitpnm2Q6ZPQ6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pitpnm2Q6ZPQ6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pitpnm2Q6ZPQ6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pitpnm2Q6ZPQ6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pitpnm2Q6ZPQ6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pitpnm2Q6ZPQ6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pitpnm2Q6ZPQ6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pitpnm2Q6ZPQ6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pitpnm2Q6ZPQ6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pitpnm2Q6ZPQ6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pitpnm2Q6ZPQ6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pitpnm2Q6ZPQ6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pitpnm2Q6ZPQ6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pitpnm2Q6ZPQ6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pitpnm2Q6ZPQ6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pitpnm2Q6ZPQ6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pitpnm2Q6ZPQ6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pitpnm2Q6ZPQ6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pitpnm2Q6ZPQ6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pitpnm2Q6ZPQ6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pitpnm2Q6ZPQ6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pitpnm2Q6ZPQ6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pitpnm2Q6ZPQ6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pitpnm2Q6ZPQ6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pitpnm2Q6ZPQ6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pitpnm2Q6ZPQ6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pitpnm2Q6ZPQ6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pitpnm2Q6ZPQ6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pitpnm2Q6ZPQ6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pitpnm2Q6ZPQ6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pitpnm2Q6ZPQ6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pitpnm2Q6ZPQ6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pitpnm2Q6ZPQ6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pitpnm2Q6ZPQ6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pitpnm2Q6ZPQ6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pitpnm2Q6ZPQ6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pitpnm2Q6ZPQ6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pitpnm2Q6ZPQ6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pitpnm2Q6ZPQ6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pitpnm2Q6ZPQ6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pitpnm2Q6ZPQ6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pitpnm2Q6ZPQ6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pitpnm2Q6ZPQ6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pitpnm2Q6ZPQ6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pitpnm2Q6ZPQ6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pitpnm2Q6ZPQ6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pitpnm2Q6ZPQ6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pitpnm2Q6ZPQ6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pitpnm2Q6ZPQ6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pitpnm2Q6ZPQ6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pitpnm2Q6ZPQ6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pitpnm2Q6ZPQ6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pitpnm2Q6ZPQ6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pitpnm2Q6ZPQ6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pitpnm2Q6ZPQ6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Pitpnm2Q6ZPQ6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pitpnm2Q6ZPQ6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pitpnm2Q6ZPQ6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pitpnm2Q6ZPQ6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pitpnm2Q6ZPQ6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Pitpnm2Q6ZPQ6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pitpnm2Q6ZPQ6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pitpnm2Q6ZPQ6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pitpnm2Q6ZPQ6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pitpnm2Q6ZPQ6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pitpnm2Q6ZPQ6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pitpnm2Q6ZPQ6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pitpnm2Q6ZPQ6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pitpnm2Q6ZPQ6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pitpnm2Q6ZPQ6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pitpnm2Q6ZPQ6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pitpnm2Q6ZPQ6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pitpnm2Q6ZPQ6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Pitpnm2Q6ZPQ6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pitpnm2Q6ZPQ6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Pitpnm2Q6ZPQ6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pitpnm2Q6ZPQ6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pitpnm2Q6ZPQ6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pitpnm2Q6ZPQ6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pitpnm2Q6ZPQ6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms