Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp7Q6A4J8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp7Q6A4J8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp7Q6A4J8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp7Q6A4J8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp7Q6A4J8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp7Q6A4J8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp7Q6A4J8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp7Q6A4J8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp7Q6A4J8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp7Q6A4J8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp7Q6A4J8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp7Q6A4J8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp7Q6A4J8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp7Q6A4J8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp7Q6A4J8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Usp7Q6A4J8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp7Q6A4J8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Usp7Q6A4J8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp7Q6A4J8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp7Q6A4J8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Usp7Q6A4J8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp7Q6A4J8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Usp7Q6A4J8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp7Q6A4J8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp7Q6A4J8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp7Q6A4J8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Usp7Q6A4J8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Usp7Q6A4J8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Usp7Q6A4J8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp7Q6A4J8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp7Q6A4J8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Usp7Q6A4J8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp7Q6A4J8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Usp7Q6A4J8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms