Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Pdzrn3Q69ZS0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pdzrn3Q69ZS0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Pdzrn3Q69ZS0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Pdzrn3Q69ZS0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Pdzrn3Q69ZS0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Pdzrn3Q69ZS0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Pdzrn3Q69ZS0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pdzrn3Q69ZS0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Pdzrn3Q69ZS0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pdzrn3Q69ZS0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pdzrn3Q69ZS0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Pdzrn3Q69ZS0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Pdzrn3Q69ZS0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Pdzrn3Q69ZS0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pdzrn3Q69ZS0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Pdzrn3Q69ZS0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pdzrn3Q69ZS0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Pdzrn3Q69ZS0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Pdzrn3Q69ZS0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Pdzrn3Q69ZS0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pdzrn3Q69ZS0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pdzrn3Q69ZS0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Pdzrn3Q69ZS0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pdzrn3Q69ZS0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pdzrn3Q69ZS0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pdzrn3Q69ZS0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pdzrn3Q69ZS0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pdzrn3Q69ZS0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Pdzrn3Q69ZS0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pdzrn3Q69ZS0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Pdzrn3Q69ZS0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pdzrn3Q69ZS0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pdzrn3Q69ZS0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pdzrn3Q69ZS0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pdzrn3Q69ZS0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pdzrn3Q69ZS0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pdzrn3Q69ZS0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Pdzrn3Q69ZS0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pdzrn3Q69ZS0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pdzrn3Q69ZS0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pdzrn3Q69ZS0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pdzrn3Q69ZS0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pdzrn3Q69ZS0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Pdzrn3Q69ZS0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pdzrn3Q69ZS0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pdzrn3Q69ZS0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pdzrn3Q69ZS0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pdzrn3Q69ZS0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pdzrn3Q69ZS0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pdzrn3Q69ZS0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pdzrn3Q69ZS0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pdzrn3Q69ZS0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pdzrn3Q69ZS0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pdzrn3Q69ZS0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Pdzrn3Q69ZS0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Pdzrn3Q69ZS0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Pdzrn3Q69ZS0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pdzrn3Q69ZS0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pdzrn3Q69ZS0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pdzrn3Q69ZS0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Pdzrn3Q69ZS0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pdzrn3Q69ZS0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Pdzrn3Q69ZS0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pdzrn3Q69ZS0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pdzrn3Q69ZS0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pdzrn3Q69ZS0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pdzrn3Q69ZS0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pdzrn3Q69ZS0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pdzrn3Q69ZS0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pdzrn3Q69ZS0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pdzrn3Q69ZS0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pdzrn3Q69ZS0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pdzrn3Q69ZS0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pdzrn3Q69ZS0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pdzrn3Q69ZS0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Pdzrn3Q69ZS0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pdzrn3Q69ZS0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pdzrn3Q69ZS0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pdzrn3Q69ZS0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pdzrn3Q69ZS0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pdzrn3Q69ZS0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pdzrn3Q69ZS0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pdzrn3Q69ZS0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pdzrn3Q69ZS0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
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