Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK0

Prex1, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex1Q69ZK0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Prex1Q69ZK0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Prex1Q69ZK0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Prex1Q69ZK0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Prex1Q69ZK0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Prex1Q69ZK0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Prex1Q69ZK0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Prex1Q69ZK0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Prex1Q69ZK0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Prex1Q69ZK0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Prex1Q69ZK0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Prex1Q69ZK0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Prex1Q69ZK0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Prex1Q69ZK0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Prex1Q69ZK0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Prex1Q69ZK0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Prex1Q69ZK0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Prex1Q69ZK0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Prex1Q69ZK0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Prex1Q69ZK0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Prex1Q69ZK0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Prex1Q69ZK0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Prex1Q69ZK0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Prex1Q69ZK0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Prex1Q69ZK0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Prex1Q69ZK0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Prex1Q69ZK0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Prex1Q69ZK0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Prex1Q69ZK0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Prex1Q69ZK0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Prex1Q69ZK0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Prex1Q69ZK0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Prex1Q69ZK0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Prex1Q69ZK0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Prex1Q69ZK0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Prex1Q69ZK0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Prex1Q69ZK0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Prex1Q69ZK0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Prex1Q69ZK0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
Prex1Q69ZK0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Prex1Q69ZK0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Prex1Q69ZK0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Prex1Q69ZK0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Prex1Q69ZK0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Prex1Q69ZK0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Prex1Q69ZK0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Prex1Q69ZK0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Prex1Q69ZK0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Prex1Q69ZK0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Prex1Q69ZK0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Prex1Q69ZK0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Prex1Q69ZK0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Prex1Q69ZK0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Prex1Q69ZK0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Prex1Q69ZK0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Prex1Q69ZK0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Prex1Q69ZK0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Prex1Q69ZK0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Prex1Q69ZK0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Prex1Q69ZK0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Prex1Q69ZK0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Prex1Q69ZK0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Prex1Q69ZK0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Prex1Q69ZK0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Prex1Q69ZK0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Prex1Q69ZK0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Prex1Q69ZK0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Prex1Q69ZK0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Prex1Q69ZK0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Prex1Q69ZK0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Prex1Q69ZK0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Prex1Q69ZK0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Prex1Q69ZK0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Prex1Q69ZK0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Prex1Q69ZK0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Prex1Q69ZK0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Prex1Q69ZK0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Prex1Q69ZK0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Prex1Q69ZK0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Prex1Q69ZK0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Prex1Q69ZK0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Prex1Q69ZK0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Prex1Q69ZK0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Prex1Q69ZK0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Prex1Q69ZK0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Prex1Q69ZK0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Prex1Q69ZK0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Prex1Q69ZK0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Prex1Q69ZK0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Prex1Q69ZK0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Prex1Q69ZK0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Prex1Q69ZK0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Prex1Q69ZK0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Prex1Q69ZK0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Prex1Q69ZK0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Prex1Q69ZK0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Prex1Q69ZK0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Prex1Q69ZK0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Prex1Q69ZK0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Prex1Q69ZK0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 771.4 ms