Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Defa17Q64016 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Defa17Q64016 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Defa17Q64016 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Defa17Q64016 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Defa17Q64016 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Defa17Q64016 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Defa17Q64016 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Defa17Q64016 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Defa17Q64016 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Defa17Q64016 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Defa17Q64016 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Defa17Q64016 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Defa17Q64016 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Defa17Q64016 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Defa17Q64016 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Defa17Q64016 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Defa17Q64016 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Defa17Q64016 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Defa17Q64016 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Defa17Q64016 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Defa17Q64016 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Defa17Q64016 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Defa17Q64016 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Defa17Q64016 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Defa17Q64016 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Defa17Q64016 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Defa17Q64016 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Defa17Q64016 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Defa17Q64016 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Defa17Q64016 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Defa17Q64016 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Defa17Q64016 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Defa17Q64016 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Defa17Q64016 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Defa17Q64016 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Defa17Q64016 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Defa17Q64016 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Defa17Q64016 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Defa17Q64016 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Defa17Q64016 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Defa17Q64016 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Defa17Q64016 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Defa17Q64016 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Defa17Q64016 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Defa17Q64016 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Defa17Q64016 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Defa17Q64016 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Defa17Q64016 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Defa17Q64016 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Defa17Q64016 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Defa17Q64016 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Defa17Q64016 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Defa17Q64016 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Defa17Q64016 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Defa17Q64016 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Defa17Q64016 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Defa17Q64016 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Defa17Q64016 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Defa17Q64016 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Defa17Q64016 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Defa17Q64016 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Defa17Q64016 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Defa17Q64016 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Defa17Q64016 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Defa17Q64016 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Defa17Q64016 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Defa17Q64016 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Defa17Q64016 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Defa17Q64016 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Defa17Q64016 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Defa17Q64016 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Defa17Q64016 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Defa17Q64016 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Defa17Q64016 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Defa17Q64016 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Defa17Q64016 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Defa17Q64016 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Defa17Q64016 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Defa17Q64016 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Defa17Q64016 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Defa17Q64016 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defa17Q64016 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defa17Q64016 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Defa17Q64016 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Defa17Q64016 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Defa17Q64016 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Defa17Q64016 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Defa17Q64016 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Defa17Q64016 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Defa17Q64016 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Defa17Q64016 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Defa17Q64016 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Defa17Q64016 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Defa17Q64016 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Defa17Q64016 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Defa17Q64016 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Defa17Q64016 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Defa17Q64016 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Defa17Q64016 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms