Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
Defa17Q64016 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Defa17Q64016 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Defa17Q64016 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Defa17Q64016 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Defa17Q64016 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Defa17Q64016 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Defa17Q64016 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Defa17Q64016 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
Defa17Q64016 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Defa17Q64016 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Defa17Q64016 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Defa17Q64016 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Defa17Q64016 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Defa17Q64016 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Defa17Q64016 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Defa17Q64016 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Defa17Q64016 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Defa17Q64016 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Defa17Q64016 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Defa17Q64016 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Defa17Q64016 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Defa17Q64016 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Defa17Q64016 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Defa17Q64016 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Defa17Q64016 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Defa17Q64016 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Defa17Q64016 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Defa17Q64016 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Defa17Q64016 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Defa17Q64016 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Defa17Q64016 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Defa17Q64016 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Defa17Q64016 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Defa17Q64016 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Defa17Q64016 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Defa17Q64016 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Defa17Q64016 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Defa17Q64016 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Defa17Q64016 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Defa17Q64016 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Defa17Q64016 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Defa17Q64016 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Defa17Q64016 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Defa17Q64016 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Defa17Q64016 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Defa17Q64016 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Defa17Q64016 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Defa17Q64016 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Defa17Q64016 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Defa17Q64016 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Defa17Q64016 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Defa17Q64016 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Defa17Q64016 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Defa17Q64016 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Defa17Q64016 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Defa17Q64016 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Defa17Q64016 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Defa17Q64016 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Defa17Q64016 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Defa17Q64016 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Defa17Q64016 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Defa17Q64016 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Defa17Q64016 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Defa17Q64016 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Defa17Q64016 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Defa17Q64016 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Defa17Q64016 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Defa17Q64016 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Defa17Q64016 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Defa17Q64016 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Defa17Q64016 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Defa17Q64016 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Defa17Q64016 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Defa17Q64016 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Defa17Q64016 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Defa17Q64016 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Defa17Q64016 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Defa17Q64016 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Defa17Q64016 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Defa17Q64016 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Defa17Q64016 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Defa17Q64016 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Defa17Q64016 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Defa17Q64016 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Defa17Q64016 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Defa17Q64016 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Defa17Q64016 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Defa17Q64016 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Defa17Q64016 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Defa17Q64016 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Defa17Q64016 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Defa17Q64016 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Defa17Q64016 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Defa17Q64016 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Defa17Q64016 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Defa17Q64016 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Defa17Q64016 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Defa17Q64016 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Defa17Q64016 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
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