Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3bQ62177 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3bQ62177 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sema3bQ62177 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sema3bQ62177 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema3bQ62177 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sema3bQ62177 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema3bQ62177 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema3bQ62177 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema3bQ62177 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema3bQ62177 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sema3bQ62177 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema3bQ62177 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema3bQ62177 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3bQ62177 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema3bQ62177 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3bQ62177 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3bQ62177 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3bQ62177 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema3bQ62177 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema3bQ62177 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema3bQ62177 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema3bQ62177 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema3bQ62177 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema3bQ62177 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3bQ62177 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3bQ62177 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3bQ62177 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3bQ62177 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sema3bQ62177 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3bQ62177 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema3bQ62177 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3bQ62177 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema3bQ62177 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema3bQ62177 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema3bQ62177 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema3bQ62177 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3bQ62177 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3bQ62177 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3bQ62177 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema3bQ62177 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema3bQ62177 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3bQ62177 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3bQ62177 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3bQ62177 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3bQ62177 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3bQ62177 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3bQ62177 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema3bQ62177 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3bQ62177 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema3bQ62177 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3bQ62177 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3bQ62177 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3bQ62177 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3bQ62177 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema3bQ62177 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sema3bQ62177 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sema3bQ62177 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3bQ62177 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3bQ62177 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3bQ62177 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3bQ62177 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema3bQ62177 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema3bQ62177 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3bQ62177 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3bQ62177 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3bQ62177 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema3bQ62177 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema3bQ62177 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema3bQ62177 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema3bQ62177 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema3bQ62177 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema3bQ62177 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema3bQ62177 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema3bQ62177 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema3bQ62177 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema3bQ62177 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3bQ62177 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3bQ62177 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3bQ62177 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3bQ62177 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3bQ62177 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3bQ62177 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3bQ62177 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3bQ62177 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3bQ62177 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema3bQ62177 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema3bQ62177 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema3bQ62177 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema3bQ62177 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sema3bQ62177 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema3bQ62177 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema3bQ62177 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema3bQ62177 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3bQ62177 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3bQ62177 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3bQ62177 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3bQ62177 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema3bQ62177 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema3bQ62177 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.2 ms