Protein–RNA interactions for Protein: Q61817

Creb3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3Q61817 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Creb3Q61817 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Creb3Q61817 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Creb3Q61817 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Creb3Q61817 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Creb3Q61817 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Creb3Q61817 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Creb3Q61817 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Creb3Q61817 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Creb3Q61817 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Creb3Q61817 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Creb3Q61817 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Creb3Q61817 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Creb3Q61817 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Creb3Q61817 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Creb3Q61817 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Creb3Q61817 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Creb3Q61817 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Creb3Q61817 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Creb3Q61817 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Creb3Q61817 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Creb3Q61817 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Creb3Q61817 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Creb3Q61817 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Creb3Q61817 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Creb3Q61817 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Creb3Q61817 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Creb3Q61817 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Creb3Q61817 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Creb3Q61817 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Creb3Q61817 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Creb3Q61817 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Creb3Q61817 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Creb3Q61817 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Creb3Q61817 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Creb3Q61817 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Creb3Q61817 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Creb3Q61817 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Creb3Q61817 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Creb3Q61817 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Creb3Q61817 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Creb3Q61817 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Creb3Q61817 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Creb3Q61817 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Creb3Q61817 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Creb3Q61817 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Creb3Q61817 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Creb3Q61817 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Creb3Q61817 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Creb3Q61817 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Creb3Q61817 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Creb3Q61817 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Creb3Q61817 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Creb3Q61817 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Creb3Q61817 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Creb3Q61817 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Creb3Q61817 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Creb3Q61817 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Creb3Q61817 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Creb3Q61817 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Creb3Q61817 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Creb3Q61817 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Creb3Q61817 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Creb3Q61817 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Creb3Q61817 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Creb3Q61817 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Creb3Q61817 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Creb3Q61817 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Creb3Q61817 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Creb3Q61817 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Creb3Q61817 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Creb3Q61817 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Creb3Q61817 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Creb3Q61817 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Creb3Q61817 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Creb3Q61817 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Creb3Q61817 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Creb3Q61817 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Creb3Q61817 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Creb3Q61817 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Creb3Q61817 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Creb3Q61817 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Creb3Q61817 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Creb3Q61817 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Creb3Q61817 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Creb3Q61817 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Creb3Q61817 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Creb3Q61817 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Creb3Q61817 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Creb3Q61817 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Creb3Q61817 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Creb3Q61817 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Creb3Q61817 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Creb3Q61817 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Creb3Q61817 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Creb3Q61817 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Creb3Q61817 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Creb3Q61817 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Creb3Q61817 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Creb3Q61817 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms