Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arcn1Q5XJY5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Arcn1Q5XJY5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arcn1Q5XJY5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Arcn1Q5XJY5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arcn1Q5XJY5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arcn1Q5XJY5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arcn1Q5XJY5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Arcn1Q5XJY5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Arcn1Q5XJY5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arcn1Q5XJY5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arcn1Q5XJY5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arcn1Q5XJY5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arcn1Q5XJY5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arcn1Q5XJY5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arcn1Q5XJY5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Arcn1Q5XJY5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Arcn1Q5XJY5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Arcn1Q5XJY5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Arcn1Q5XJY5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Arcn1Q5XJY5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Arcn1Q5XJY5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arcn1Q5XJY5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arcn1Q5XJY5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arcn1Q5XJY5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arcn1Q5XJY5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arcn1Q5XJY5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arcn1Q5XJY5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Arcn1Q5XJY5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arcn1Q5XJY5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arcn1Q5XJY5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arcn1Q5XJY5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arcn1Q5XJY5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arcn1Q5XJY5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arcn1Q5XJY5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arcn1Q5XJY5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arcn1Q5XJY5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Arcn1Q5XJY5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Arcn1Q5XJY5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arcn1Q5XJY5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arcn1Q5XJY5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arcn1Q5XJY5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arcn1Q5XJY5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arcn1Q5XJY5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arcn1Q5XJY5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Arcn1Q5XJY5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arcn1Q5XJY5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Arcn1Q5XJY5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arcn1Q5XJY5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Arcn1Q5XJY5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Arcn1Q5XJY5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arcn1Q5XJY5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Arcn1Q5XJY5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arcn1Q5XJY5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arcn1Q5XJY5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arcn1Q5XJY5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arcn1Q5XJY5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arcn1Q5XJY5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arcn1Q5XJY5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arcn1Q5XJY5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arcn1Q5XJY5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Arcn1Q5XJY5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arcn1Q5XJY5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arcn1Q5XJY5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arcn1Q5XJY5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arcn1Q5XJY5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arcn1Q5XJY5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arcn1Q5XJY5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Arcn1Q5XJY5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Arcn1Q5XJY5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Arcn1Q5XJY5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Arcn1Q5XJY5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Arcn1Q5XJY5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Arcn1Q5XJY5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arcn1Q5XJY5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Arcn1Q5XJY5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arcn1Q5XJY5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arcn1Q5XJY5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arcn1Q5XJY5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arcn1Q5XJY5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Arcn1Q5XJY5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arcn1Q5XJY5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arcn1Q5XJY5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arcn1Q5XJY5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arcn1Q5XJY5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Arcn1Q5XJY5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arcn1Q5XJY5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arcn1Q5XJY5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Arcn1Q5XJY5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arcn1Q5XJY5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arcn1Q5XJY5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Arcn1Q5XJY5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Arcn1Q5XJY5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Arcn1Q5XJY5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arcn1Q5XJY5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Arcn1Q5XJY5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arcn1Q5XJY5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Arcn1Q5XJY5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arcn1Q5XJY5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Arcn1Q5XJY5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Arcn1Q5XJY5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
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