Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SynrgQ5SV85 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SynrgQ5SV85 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SynrgQ5SV85 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SynrgQ5SV85 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SynrgQ5SV85 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SynrgQ5SV85 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SynrgQ5SV85 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SynrgQ5SV85 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SynrgQ5SV85 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SynrgQ5SV85 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SynrgQ5SV85 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SynrgQ5SV85 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SynrgQ5SV85 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SynrgQ5SV85 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SynrgQ5SV85 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SynrgQ5SV85 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SynrgQ5SV85 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SynrgQ5SV85 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SynrgQ5SV85 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SynrgQ5SV85 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SynrgQ5SV85 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SynrgQ5SV85 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SynrgQ5SV85 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SynrgQ5SV85 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SynrgQ5SV85 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SynrgQ5SV85 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SynrgQ5SV85 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SynrgQ5SV85 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SynrgQ5SV85 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SynrgQ5SV85 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SynrgQ5SV85 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SynrgQ5SV85 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SynrgQ5SV85 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SynrgQ5SV85 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SynrgQ5SV85 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SynrgQ5SV85 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
SynrgQ5SV85 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SynrgQ5SV85 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SynrgQ5SV85 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SynrgQ5SV85 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SynrgQ5SV85 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SynrgQ5SV85 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SynrgQ5SV85 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SynrgQ5SV85 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SynrgQ5SV85 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SynrgQ5SV85 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SynrgQ5SV85 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SynrgQ5SV85 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SynrgQ5SV85 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SynrgQ5SV85 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SynrgQ5SV85 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SynrgQ5SV85 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SynrgQ5SV85 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SynrgQ5SV85 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SynrgQ5SV85 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SynrgQ5SV85 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SynrgQ5SV85 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SynrgQ5SV85 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SynrgQ5SV85 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SynrgQ5SV85 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SynrgQ5SV85 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SynrgQ5SV85 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SynrgQ5SV85 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SynrgQ5SV85 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SynrgQ5SV85 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SynrgQ5SV85 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SynrgQ5SV85 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SynrgQ5SV85 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SynrgQ5SV85 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SynrgQ5SV85 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SynrgQ5SV85 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SynrgQ5SV85 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SynrgQ5SV85 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SynrgQ5SV85 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SynrgQ5SV85 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SynrgQ5SV85 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SynrgQ5SV85 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SynrgQ5SV85 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SynrgQ5SV85 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SynrgQ5SV85 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SynrgQ5SV85 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SynrgQ5SV85 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SynrgQ5SV85 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SynrgQ5SV85 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SynrgQ5SV85 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SynrgQ5SV85 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SynrgQ5SV85 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SynrgQ5SV85 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SynrgQ5SV85 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SynrgQ5SV85 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SynrgQ5SV85 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SynrgQ5SV85 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SynrgQ5SV85 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SynrgQ5SV85 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SynrgQ5SV85 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SynrgQ5SV85 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SynrgQ5SV85 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SynrgQ5SV85 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SynrgQ5SV85 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms