Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Mdc1Q5PSV9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Mdc1Q5PSV9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Mdc1Q5PSV9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33■■■□□ 2.87
Mdc1Q5PSV9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Mdc1Q5PSV9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Mdc1Q5PSV9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Mdc1Q5PSV9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Mdc1Q5PSV9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Mdc1Q5PSV9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Mdc1Q5PSV9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Mdc1Q5PSV9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Mdc1Q5PSV9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Mdc1Q5PSV9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Mdc1Q5PSV9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
Mdc1Q5PSV9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Mdc1Q5PSV9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Mdc1Q5PSV9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Mdc1Q5PSV9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Mdc1Q5PSV9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Mdc1Q5PSV9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Mdc1Q5PSV9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Mdc1Q5PSV9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Mdc1Q5PSV9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Mdc1Q5PSV9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
Mdc1Q5PSV9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Mdc1Q5PSV9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Mdc1Q5PSV9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Mdc1Q5PSV9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Mdc1Q5PSV9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Mdc1Q5PSV9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Mdc1Q5PSV9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Mdc1Q5PSV9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Mdc1Q5PSV9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Mdc1Q5PSV9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Mdc1Q5PSV9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Mdc1Q5PSV9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Mdc1Q5PSV9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Mdc1Q5PSV9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Mdc1Q5PSV9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Mdc1Q5PSV9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Mdc1Q5PSV9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Mdc1Q5PSV9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Mdc1Q5PSV9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Mdc1Q5PSV9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Mdc1Q5PSV9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Mdc1Q5PSV9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Mdc1Q5PSV9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Mdc1Q5PSV9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Mdc1Q5PSV9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Mdc1Q5PSV9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Mdc1Q5PSV9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Mdc1Q5PSV9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Mdc1Q5PSV9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Mdc1Q5PSV9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Mdc1Q5PSV9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Mdc1Q5PSV9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Mdc1Q5PSV9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Mdc1Q5PSV9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Mdc1Q5PSV9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Mdc1Q5PSV9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Mdc1Q5PSV9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Mdc1Q5PSV9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Mdc1Q5PSV9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Mdc1Q5PSV9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Mdc1Q5PSV9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Mdc1Q5PSV9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Mdc1Q5PSV9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Mdc1Q5PSV9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Mdc1Q5PSV9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Mdc1Q5PSV9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Mdc1Q5PSV9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Mdc1Q5PSV9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Mdc1Q5PSV9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Mdc1Q5PSV9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Mdc1Q5PSV9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Mdc1Q5PSV9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Mdc1Q5PSV9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Mdc1Q5PSV9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Mdc1Q5PSV9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Mdc1Q5PSV9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Mdc1Q5PSV9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Mdc1Q5PSV9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Mdc1Q5PSV9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Mdc1Q5PSV9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Mdc1Q5PSV9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Mdc1Q5PSV9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Mdc1Q5PSV9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Mdc1Q5PSV9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Mdc1Q5PSV9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Mdc1Q5PSV9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Mdc1Q5PSV9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Mdc1Q5PSV9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Mdc1Q5PSV9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Mdc1Q5PSV9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Mdc1Q5PSV9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Mdc1Q5PSV9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Mdc1Q5PSV9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Mdc1Q5PSV9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Mdc1Q5PSV9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms