Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc84Q4VA36 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc84Q4VA36 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc84Q4VA36 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc84Q4VA36 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc84Q4VA36 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc84Q4VA36 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc84Q4VA36 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc84Q4VA36 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc84Q4VA36 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc84Q4VA36 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc84Q4VA36 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc84Q4VA36 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc84Q4VA36 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc84Q4VA36 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc84Q4VA36 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc84Q4VA36 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc84Q4VA36 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc84Q4VA36 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc84Q4VA36 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc84Q4VA36 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc84Q4VA36 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc84Q4VA36 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc84Q4VA36 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc84Q4VA36 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc84Q4VA36 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc84Q4VA36 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc84Q4VA36 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc84Q4VA36 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc84Q4VA36 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc84Q4VA36 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc84Q4VA36 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc84Q4VA36 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc84Q4VA36 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc84Q4VA36 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc84Q4VA36 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc84Q4VA36 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc84Q4VA36 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc84Q4VA36 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc84Q4VA36 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc84Q4VA36 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc84Q4VA36 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc84Q4VA36 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc84Q4VA36 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc84Q4VA36 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc84Q4VA36 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc84Q4VA36 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc84Q4VA36 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc84Q4VA36 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc84Q4VA36 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc84Q4VA36 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc84Q4VA36 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc84Q4VA36 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc84Q4VA36 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc84Q4VA36 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc84Q4VA36 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ccdc84Q4VA36 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc84Q4VA36 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc84Q4VA36 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc84Q4VA36 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc84Q4VA36 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc84Q4VA36 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc84Q4VA36 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc84Q4VA36 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc84Q4VA36 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc84Q4VA36 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc84Q4VA36 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc84Q4VA36 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc84Q4VA36 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc84Q4VA36 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc84Q4VA36 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc84Q4VA36 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc84Q4VA36 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc84Q4VA36 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc84Q4VA36 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc84Q4VA36 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc84Q4VA36 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc84Q4VA36 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc84Q4VA36 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc84Q4VA36 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc84Q4VA36 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc84Q4VA36 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc84Q4VA36 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc84Q4VA36 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc84Q4VA36 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc84Q4VA36 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc84Q4VA36 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc84Q4VA36 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc84Q4VA36 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc84Q4VA36 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc84Q4VA36 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc84Q4VA36 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc84Q4VA36 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc84Q4VA36 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc84Q4VA36 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc84Q4VA36 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc84Q4VA36 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc84Q4VA36 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc84Q4VA36 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc84Q4VA36 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms