Protein–RNA interactions for Protein: Q497V5

Srbd1, S1 RNA-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srbd1Q497V5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Srbd1Q497V5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Srbd1Q497V5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Srbd1Q497V5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Srbd1Q497V5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Srbd1Q497V5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Srbd1Q497V5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Srbd1Q497V5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Srbd1Q497V5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Srbd1Q497V5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Srbd1Q497V5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Srbd1Q497V5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srbd1Q497V5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srbd1Q497V5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srbd1Q497V5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Srbd1Q497V5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Srbd1Q497V5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Srbd1Q497V5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Srbd1Q497V5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Srbd1Q497V5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Srbd1Q497V5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srbd1Q497V5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srbd1Q497V5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srbd1Q497V5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srbd1Q497V5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srbd1Q497V5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srbd1Q497V5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srbd1Q497V5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srbd1Q497V5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srbd1Q497V5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srbd1Q497V5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srbd1Q497V5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srbd1Q497V5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srbd1Q497V5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srbd1Q497V5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srbd1Q497V5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Srbd1Q497V5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srbd1Q497V5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srbd1Q497V5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Srbd1Q497V5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Srbd1Q497V5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srbd1Q497V5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Srbd1Q497V5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Srbd1Q497V5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Srbd1Q497V5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Srbd1Q497V5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Srbd1Q497V5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Srbd1Q497V5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Srbd1Q497V5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Srbd1Q497V5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Srbd1Q497V5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Srbd1Q497V5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Srbd1Q497V5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms