Protein–RNA interactions for Protein: Q12112

TY1B-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-NL1Q12112 MOB1YIL106W 945 nt13.48□□□□□ -0.25
TY1B-NL1Q12112 RPL12BYDR418W 498 nt13.48□□□□□ -0.25
TY1B-NL1Q12112 MFG1YDL233W 1377 nt13.47□□□□□ -0.25
TY1B-NL1Q12112 YPS3YLR121C 1527 nt13.46□□□□□ -0.25
TY1B-NL1Q12112 URA6YKL024C 615 nt13.44□□□□□ -0.26
TY1B-NL1Q12112 DLD2YDL178W 1593 nt13.43□□□□□ -0.26
TY1B-NL1Q12112 OSH7YHR001W 1314 nt13.43□□□□□ -0.26
TY1B-NL1Q12112 YDR455CYDR455C 309 nt13.41□□□□□ -0.26
TY1B-NL1Q12112 HEM13YDR044W 987 nt13.4□□□□□ -0.26
TY1B-NL1Q12112 SER2YGR208W 930 nt13.4□□□□□ -0.26
TY1B-NL1Q12112 PET8YNL003C 855 nt13.4□□□□□ -0.26
TY1B-NL1Q12112 RCR1YBR005W 642 nt13.4□□□□□ -0.26
TY1B-NL1Q12112 SOL2YCR073W-A 948 nt13.4□□□□□ -0.26
TY1B-NL1Q12112 IMO32YGR031W 1029 nt13.4□□□□□ -0.26
TY1B-NL1Q12112 TAT2YOL020W 1779 nt13.39□□□□□ -0.27
TY1B-NL1Q12112 OXA1YER154W 1209 nt13.37□□□□□ -0.27
TY1B-NL1Q12112 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt13.37□□□□□ -0.27
TY1B-NL1Q12112 YMR206WYMR206W 942 nt13.36□□□□□ -0.27
TY1B-NL1Q12112 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt13.34□□□□□ -0.27
TY1B-NL1Q12112 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt13.34□□□□□ -0.27
TY1B-NL1Q12112 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt13.34□□□□□ -0.27
TY1B-NL1Q12112 SUP51tL(UAA)J 84 nt13.34□□□□□ -0.27
TY1B-NL1Q12112 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt13.34□□□□□ -0.27
TY1B-NL1Q12112 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt13.34□□□□□ -0.27
TY1B-NL1Q12112 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt13.34□□□□□ -0.27
TY1B-NL1Q12112 YOR268CYOR268C 399 nt13.34□□□□□ -0.27
TY1B-NL1Q12112 HTS1YPR033C 1641 nt13.33□□□□□ -0.28
TY1B-NL1Q12112 ENO2YHR174W 1314 nt13.33□□□□□ -0.28
TY1B-NL1Q12112 FMS1YMR020W 1527 nt13.32□□□□□ -0.28
TY1B-NL1Q12112 EMC3YKL207W 762 nt13.32□□□□□ -0.28
TY1B-NL1Q12112 ERG13YML126C 1476 nt13.31□□□□□ -0.28
TY1B-NL1Q12112 SPP2YOR148C 558 nt13.31□□□□□ -0.28
TY1B-NL1Q12112 BET2YPR176C 978 nt13.3□□□□□ -0.28
TY1B-NL1Q12112 BIO5YNR056C 1686 nt13.23□□□□□ -0.29
TY1B-NL1Q12112 YJL067WYJL067W 351 nt13.23□□□□□ -0.29
TY1B-NL1Q12112 SRP102YKL154W 735 nt13.22□□□□□ -0.29
TY1B-NL1Q12112 PET18YCR020C 648 nt13.22□□□□□ -0.29
TY1B-NL1Q12112 ERO1YML130C 1692 nt13.21□□□□□ -0.29
TY1B-NL1Q12112 HRA1HRA1 564 nt13.21□□□□□ -0.29
TY1B-NL1Q12112 SDS24YBR214W 1584 nt13.18□□□□□ -0.3
TY1B-NL1Q12112 YMR210WYMR210W 1350 nt13.18□□□□□ -0.3
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TY1B-NL1Q12112 ELP4YPL101W 1371 nt13.17□□□□□ -0.3
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TY1B-NL1Q12112 TPC1YGR096W 945 nt13.13□□□□□ -0.31
TY1B-NL1Q12112 REX2YLR059C 810 nt13.12□□□□□ -0.31
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TY1B-NL1Q12112 BOR1YNL275W 1731 nt12.92□□□□□ -0.34
TY1B-NL1Q12112 LSP1YPL004C 1026 nt12.9□□□□□ -0.34
TY1B-NL1Q12112 MRP1YDR347W 966 nt12.88□□□□□ -0.35
TY1B-NL1Q12112 LSB6YJL100W 1824 nt12.85□□□□□ -0.35
TY1B-NL1Q12112 ADE1YAR015W 921 nt12.84□□□□□ -0.35
TY1B-NL1Q12112 SWT21YNL187W 1074 nt12.83□□□□□ -0.36
TY1B-NL1Q12112 SFL1YOR140W 2301 nt12.82□□□□□ -0.36
TY1B-NL1Q12112 VPS62YGR141W 1404 nt12.8□□□□□ -0.36
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TY1B-NL1Q12112 YJL043WYJL043W 774 nt12.66□□□□□ -0.38
TY1B-NL1Q12112 CCT2YIL142W 1584 nt12.64□□□□□ -0.39
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