Protein–RNA interactions for Protein: Q12010

YPQ1, Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPQ1Q12010 RRT8YOL048C 1029 nt8.96□□□□□ -0.98
YPQ1Q12010 ADE8YDR408C 645 nt8.95□□□□□ -0.98
YPQ1Q12010 ASP3-1YLR155C 1089 nt8.93□□□□□ -0.98
YPQ1Q12010 ASP3-2YLR157C 1089 nt8.93□□□□□ -0.98
YPQ1Q12010 ASP3-3YLR158C 1089 nt8.93□□□□□ -0.98
YPQ1Q12010 ASP3-4YLR160C 1089 nt8.93□□□□□ -0.98
YPQ1Q12010 ABZ2YMR289W 1125 nt8.93□□□□□ -0.98
YPQ1Q12010 ERG13YML126C 1476 nt8.92□□□□□ -0.98
YPQ1Q12010 TVP23YDR084C 600 nt8.92□□□□□ -0.98
YPQ1Q12010 ACO2YJL200C 2370 nt8.92□□□□□ -0.98
YPQ1Q12010 POP2YNR052C 1302 nt8.9□□□□□ -0.98
YPQ1Q12010 YER152W-AYER152W-A 567 nt8.9□□□□□ -0.98
YPQ1Q12010 VPS62YGR141W 1404 nt8.89□□□□□ -0.99
YPQ1Q12010 LYS20YDL182W 1287 nt8.89□□□□□ -0.99
YPQ1Q12010 SWM1YDR260C 513 nt8.89□□□□□ -0.99
YPQ1Q12010 SPE2YOL052C 1191 nt8.89□□□□□ -0.99
YPQ1Q12010 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.89□□□□□ -0.99
YPQ1Q12010 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.89□□□□□ -0.99
YPQ1Q12010 THP3YPR045C 1413 nt8.88□□□□□ -0.99
YPQ1Q12010 FLX1YIL134W 936 nt8.88□□□□□ -0.99
YPQ1Q12010 OPI3YJR073C 621 nt8.86□□□□□ -0.99
YPQ1Q12010 CYT2YKL087C 675 nt8.86□□□□□ -0.99
YPQ1Q12010 PHB2YGR231C 933 nt8.85□□□□□ -0.99
YPQ1Q12010 ADH3YMR083W 1128 nt8.84□□□□□ -0.99
YPQ1Q12010 QDR2YIL121W 1629 nt8.83□□□□□ -1
YPQ1Q12010 YDL086WYDL086W 822 nt8.83□□□□□ -1
YPQ1Q12010 NAR1YNL240C 1476 nt8.82□□□□□ -1
YPQ1Q12010 FSH2YMR222C 672 nt8.81□□□□□ -1
YPQ1Q12010 ENO2YHR174W 1314 nt8.8□□□□□ -1
YPQ1Q12010 TPC1YGR096W 945 nt8.8□□□□□ -1
YPQ1Q12010 AIM1YAL046C 357 nt8.8□□□□□ -1
YPQ1Q12010 SAC7YDR389W 1965 nt8.8□□□□□ -1
YPQ1Q12010 SER2YGR208W 930 nt8.79□□□□□ -1
YPQ1Q12010 MOB1YIL106W 945 nt8.79□□□□□ -1
YPQ1Q12010 BUD20YLR074C 501 nt8.78□□□□□ -1
YPQ1Q12010 AMF1YOR378W 1548 nt8.77□□□□□ -1.01
YPQ1Q12010 YMR007WYMR007W 381 nt8.77□□□□□ -1.01
YPQ1Q12010 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt8.76□□□□□ -1.01
YPQ1Q12010 CYC3YAL039C 810 nt8.76□□□□□ -1.01
YPQ1Q12010 BET2YPR176C 978 nt8.76□□□□□ -1.01
YPQ1Q12010 YAT1YAR035W 2064 nt8.74□□□□□ -1.01
YPQ1Q12010 PCP1YGR101W 1041 nt8.74□□□□□ -1.01
YPQ1Q12010 YKR012CYKR012C 378 nt8.73□□□□□ -1.01
YPQ1Q12010 MCH5YOR306C 1566 nt8.73□□□□□ -1.01
YPQ1Q12010 DIG1YPL049C 1359 nt8.73□□□□□ -1.01
YPQ1Q12010 YNR064CYNR064C 873 nt8.72□□□□□ -1.01
YPQ1Q12010 RCR1YBR005W 642 nt8.72□□□□□ -1.01
YPQ1Q12010 HTS1YPR033C 1641 nt8.72□□□□□ -1.01
YPQ1Q12010 INA1YLR413W 2028 nt8.71□□□□□ -1.01
YPQ1Q12010 LSB6YJL100W 1824 nt8.71□□□□□ -1.01
YPQ1Q12010 ENT4YLL038C 744 nt8.71□□□□□ -1.02
YPQ1Q12010 LEU2YCL018W 1095 nt8.71□□□□□ -1.02
YPQ1Q12010 YOR325WYOR325W 474 nt8.7□□□□□ -1.02
YPQ1Q12010 CCT2YIL142W 1584 nt8.69□□□□□ -1.02
YPQ1Q12010 FRE6YLL051C 2139 nt8.69□□□□□ -1.02
YPQ1Q12010 NAM8YHR086W 1572 nt8.69□□□□□ -1.02
YPQ1Q12010 TGA1tA(UGC)A 73 nt8.68□□□□□ -1.02
YPQ1Q12010 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt8.68□□□□□ -1.02
YPQ1Q12010 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt8.68□□□□□ -1.02
YPQ1Q12010 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt8.68□□□□□ -1.02
YPQ1Q12010 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt8.68□□□□□ -1.02
YPQ1Q12010 SDS24YBR214W 1584 nt8.68□□□□□ -1.02
YPQ1Q12010 RPC82YPR190C 1965 nt8.68□□□□□ -1.02
YPQ1Q12010 YLR046CYLR046C 813 nt8.66□□□□□ -1.02
YPQ1Q12010 YGR210CYGR210C 1236 nt8.65□□□□□ -1.02
YPQ1Q12010 ELO1YJL196C 933 nt8.65□□□□□ -1.02
YPQ1Q12010 SRP102YKL154W 735 nt8.65□□□□□ -1.02
YPQ1Q12010 OPI10YOL032W 741 nt8.64□□□□□ -1.03
YPQ1Q12010 YOR343CYOR343C 327 nt8.64□□□□□ -1.03
YPQ1Q12010 PAU21YOR394W 495 nt8.64□□□□□ -1.03
YPQ1Q12010 PAU22YPL282C 495 nt8.64□□□□□ -1.03
YPQ1Q12010 FCY1YPR062W 477 nt8.64□□□□□ -1.03
YPQ1Q12010 ERO1YML130C 1692 nt8.63□□□□□ -1.03
YPQ1Q12010 ENO1YGR254W 1314 nt8.63□□□□□ -1.03
YPQ1Q12010 YLR280CYLR280C 351 nt8.63□□□□□ -1.03
YPQ1Q12010 SWT21YNL187W 1074 nt8.63□□□□□ -1.03
YPQ1Q12010 ILV3YJR016C 1758 nt8.63□□□□□ -1.03
YPQ1Q12010 SFL1YOR140W 2301 nt8.63□□□□□ -1.03
YPQ1Q12010 VBA3YCL069W 1377 nt8.62□□□□□ -1.03
YPQ1Q12010 KEL3YPL263C 1956 nt8.62□□□□□ -1.03
YPQ1Q12010 REX2YLR059C 810 nt8.59□□□□□ -1.03
YPQ1Q12010 GRH1YDR517W 1119 nt8.58□□□□□ -1.04
YPQ1Q12010 ITR2YOL103W 1830 nt8.58□□□□□ -1.04
YPQ1Q12010 MET1YKR069W 1782 nt8.58□□□□□ -1.04
YPQ1Q12010 RPL12BYDR418W 498 nt8.57□□□□□ -1.04
YPQ1Q12010 HRA1HRA1 564 nt8.57□□□□□ -1.04
YPQ1Q12010 SUV3YPL029W 2214 nt8.56□□□□□ -1.04
YPQ1Q12010 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt8.56□□□□□ -1.04
YPQ1Q12010 YKL053WYKL053W 375 nt8.56□□□□□ -1.04
YPQ1Q12010 YPL108WYPL108W 507 nt8.56□□□□□ -1.04
YPQ1Q12010 EMC3YKL207W 762 nt8.55□□□□□ -1.04
YPQ1Q12010 DLD3YEL071W 1491 nt8.54□□□□□ -1.04
YPQ1Q12010 YJL160CYJL160C 864 nt8.54□□□□□ -1.04
YPQ1Q12010 SRP54YPR088C 1626 nt8.53□□□□□ -1.04
YPQ1Q12010 snR31snR31 225 nt8.51□□□□□ -1.05
YPQ1Q12010 HAP5YOR358W 729 nt8.5□□□□□ -1.05
YPQ1Q12010 ARO8YGL202W 1503 nt8.49□□□□□ -1.05
YPQ1Q12010 YMR210WYMR210W 1350 nt8.49□□□□□ -1.05
YPQ1Q12010 YMR265CYMR265C 1386 nt8.49□□□□□ -1.05
YPQ1Q12010 YFR020WYFR020W 699 nt8.49□□□□□ -1.05
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